More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3912 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3912  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 309 aa  633    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5619  LysR family transcriptional regulator  67.53 
 
 		 309 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.272511 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5211  LysR family transcriptional regulator  68.61 
 
 		 309 aa  434  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4089  LysR family transcriptional regulator  68.28 
 
 		 309 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00576111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3428  LysR family transcriptional regulator  68.28 
 
 		 309 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6075  LysR family transcriptional regulator  68.61 
 
 		 309 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3373  LysR family transcriptional regulator  68.28 
 
 		 309 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2741  LysR family transcriptional regulator  68.61 
 
 		 309 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0243  putative transcriptional regulator transcription regulator protein  62.9 
 
 		 310 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26390  LysR family transcriptional regulator protein  64.11 
 
 		 311 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6127  transcriptional regulator, LysR family  48.04 
 
 		 316 aa  306  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0953  transcriptional regulator, LysR family  34.45 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  33.22 
 
 		 307 aa  195  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  33.22 
 
 		 302 aa  193  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  34.67 
 
 		 305 aa  192  7e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0833  transcriptional regulator, LysR family  33.44 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2979  transcriptional regulator, LysR family  36.45 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438714  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2456  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 313 aa  189  5e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.161377  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  33.22 
 
 		 297 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3280  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 303 aa  188  8e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190175  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  32.77 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6129  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 305 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3206  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  34.28 
 
 		 298 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1324  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 313 aa  176  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.230209 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1339  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 300 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.150488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4334  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 302 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2002  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 301 aa  176  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00230596  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0155  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 312 aa  176  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0458494  normal  0.226334 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 302 aa  175  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.33 
 
 		 299 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3062  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.42 
 
 		 298 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 322 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1113  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.800719  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1224  carbonate dehydratase  31.37 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000421173  normal  0.31799 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1682  putative transcriptional regulator  34.12 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177927  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4992  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.88 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170896  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2485  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.434999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2297  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000212474  hitchhiker  0.000857441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.53 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1403  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3048  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0118588  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3191  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0504852  normal  0.2192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1330  transcriptional regulator, LysR family  30.72 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00626709  hitchhiker  0.000619665 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 306 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1128  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 313 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0593  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 303 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 294 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3363  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 312 aa  172  9e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0686  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 303 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.866247  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1186  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1984  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1256  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00128178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3034  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  31.37 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1480  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  31.33 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  31.33 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4209  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 304 aa  170  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4487  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0430  transcriptional regulator, LysR family  32.47 
 
 		 312 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.716475 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0824  LysR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 309 aa  169  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 303 aa  169  4e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  32.41 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2043  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 310 aa  169  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4276  transcriptional regulator, LysR family  31.54 
 
 		 307 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1328  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 307 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.277671 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1185  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 313 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0305189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 298 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1296  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 301 aa  169  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2734  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 306 aa  169  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2695  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 337 aa  169  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.933352  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2375  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 301 aa  169  7e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00507322  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4278  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 312 aa  169  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.105517 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1541  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 301 aa  169  7e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.827921  normal  0.805114 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2531  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 301 aa  168  8e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4814  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 302 aa  169  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1833  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 294 aa  168  9e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1199  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  29.33 
 
 		 300 aa  168  9e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  32 
 
 		 335 aa  168  9e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1356  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 301 aa  168  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1859  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 300 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.348315  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1344  transcriptional regulator, LysR family  30.72 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00247694  normal  0.0669225 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.367716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>