More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2742 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2742  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 292 aa  564  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32360  lysR family transcriptional regulator  92.47 
 
 		 292 aa  521  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0231568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4056  transcriptional regulator, LysR family  76.11 
 
 		 295 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3943  transcriptional regulator, LysR family  76.11 
 
 		 295 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  0.897444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2204  LysR family transcriptional regulator  55.99 
 
 		 306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1326  LysR family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 284 aa  265  8e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0745  LysR family transcriptional regulator  51.59 
 
 		 287 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0877  transcriptional regulator, LysR family  49.82 
 
 		 287 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5384  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  52.86 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.629114  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0804  LysR family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 288 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2391  transcriptional regulator, LysR family  49.06 
 
 		 293 aa  235  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.586074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0105  LysR family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 284 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2390  LysR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610355 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3534  LysR family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 293 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2239  LysR family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 293 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1284  LysR family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 283 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3053  LysR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 307 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5238  LysR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 287 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4609  LysR family transcriptional regulator  48.13 
 
 		 287 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46805  hitchhiker  0.000318313 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5621  LysR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 287 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4236  transcriptional regulator  47.94 
 
 		 309 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.999782  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3226  LysR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 306 aa  229  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49640  transcriptional regulator  47.94 
 
 		 300 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.097129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0070  LysR family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 286 aa  228  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4898  LysR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 288 aa  228  8e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3591  LysR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 292 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449761 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5448  LysR family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 288 aa  225  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.778769 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0242  LysR family transcriptional regulator  49.11 
 
 		 287 aa  225  8e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.546914  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1058  LysR family transcriptional regulator  46.35 
 
 		 288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2346  transcriptional regulator, LysR family  46.35 
 
 		 293 aa  220  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2662  LysR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 307 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0323  LysR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5843  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 282 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2046  LysR family transcriptional regulator  48.26 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396353  normal  0.96684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3803  LysR family transcriptional regulator  46.42 
 
 		 285 aa  191  8e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180645 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2921  LysR family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 283 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3829  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0185  LysR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2626  transcriptional regulator, LysR family  37.88 
 
 		 290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117522  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0615  transcription regulator protein  40.6 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.528971 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2757  LysR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  39.62 
 
 		 309 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0087  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4450  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0818  transcriptional regulator, LysR family  38.89 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0971009  normal  0.428032 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2125  HTH-type transcriptional regulator  37.45 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1647  LysR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 289 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3309  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 311 aa  155  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000301615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0438  transcriptional regulator, LysR family  35.36 
 
 		 322 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0482  transcriptional regulator, LysR family  35.36 
 
 		 322 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0384  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 316 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21400  Transcriptional regulator, LysR family  35.23 
 
 		 317 aa  155  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2514  HTH-type transcriptional regulator PecT  36.74 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00051335  normal  0.704874 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2676  HTH-type transcriptional regulator PecT  36.74 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.784227 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2469  HTH-type transcriptional regulator PecT  36.74 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000182505  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3167  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1479  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0277632  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0765  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 322 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2558  HTH-type transcriptional regulator PecT  36.36 
 
 		 312 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000175067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4222  transcriptional regulator, LysR family  38.64 
 
 		 293 aa  152  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2569  HTH-type transcriptional regulator PecT  36.36 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00146874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0683  LysR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2002  transcriptional regulator, LysR family  37.45 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1683  LysR substrate-binding  37.45 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2995  LysR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3040  LysR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 282 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3993  LysR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 296 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0535  LysR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 286 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.605661  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1252  LysR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 286 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0618  LysR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 286 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1478  LysR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 286 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4825  transcriptional regulator, LysR family  37.1 
 
 		 293 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0864247  normal  0.0253512 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4357  transcriptional regulator, LysR family  38.78 
 
 		 283 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1578  LysR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 367 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.170227  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0717  transcriptional regulator, LysR family  39.83 
 
 		 292 aa  149  8e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1448  LysR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 321 aa  148  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4012  transcriptional regulator, LysR family  34.39 
 
 		 285 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1788  LysR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324618 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3882  LysR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2354  LysR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1838  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2713  LysR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0696841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5774  transcriptional regulator LysR family  35.42 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1559  LysR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 310 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.30474  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2773  transcriptional regulator, LysR family  36.4 
 
 		 316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.785949  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3618  transcriptional regulator, LysR family  39.66 
 
 		 284 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12140  putative transcriptional regulator  38.35 
 
 		 297 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2806  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 286 aa  145  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469753  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0109  transcriptional regulator, LysR family  36.23 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1608  LysR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2383  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1817  LysR-family transcriptional regulatory protein  39.44 
 
 		 309 aa  145  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1452  transcriptional regulator LrhA  39.44 
 
 		 309 aa  145  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2821  LysR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2951  transcriptional regulator, LysR family  36.5 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5203  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.715781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5091  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0219442 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6530  LysR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>