268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1952 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 315 aa  646    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  42.86 
 
 		 329 aa  247  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  40 
 
 		 321 aa  242  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  42.71 
 
 		 329 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  37.8 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  37.89 
 
 		 330 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  35.12 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  35.06 
 
 		 331 aa  202  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  33.55 
 
 		 330 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.36 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  36.69 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  37.54 
 
 		 333 aa  192  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  35.35 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  35.62 
 
 		 334 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  36.09 
 
 		 351 aa  188  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  34.93 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  36.86 
 
 		 326 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  34.98 
 
 		 330 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  36.49 
 
 		 304 aa  185  7e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  34.93 
 
 		 336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  35.15 
 
 		 311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  34.11 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  31.88 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  35.23 
 
 		 329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  33.66 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  33.11 
 
 		 329 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  34.47 
 
 		 332 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  32.76 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  33.9 
 
 		 327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  32.43 
 
 		 332 aa  172  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  33.8 
 
 		 327 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  33.56 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  35.43 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  33.8 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  36.24 
 
 		 329 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  34.04 
 
 		 322 aa  169  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  34.01 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  33.56 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  35.89 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  32.65 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  35.4 
 
 		 332 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  33.22 
 
 		 324 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  34.87 
 
 		 339 aa  166  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  32.54 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  30.87 
 
 		 327 aa  163  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  31.63 
 
 		 322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  35.29 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0612  beta-lactamase domain protein  33.22 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  32.52 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  32.99 
 
 		 320 aa  161  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  35.84 
 
 		 329 aa  159  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  33.45 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  34.95 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  32.54 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  33.92 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  33.68 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  32.07 
 
 		 293 aa  153  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  32.07 
 
 		 293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  31.36 
 
 		 344 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  31.71 
 
 		 348 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  31.71 
 
 		 348 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  31.56 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  30.96 
 
 		 300 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  33.22 
 
 		 279 aa  149  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  32.97 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0380  beta-lactamase domain-containing protein  33.22 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  33.69 
 
 		 318 aa  145  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2457  beta-lactamase domain-containing protein  32.52 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.047493 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  32.01 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  30.72 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  33.56 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0799  hypothetical protein  32.52 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  32.53 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  32.76 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  32.01 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  31.32 
 
 		 312 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  28.82 
 
 		 316 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  31.82 
 
 		 238 aa  139  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  30.9 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  31.77 
 
 		 283 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  31.6 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  33.81 
 
 		 277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  30.04 
 
 		 287 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  34.51 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  28.57 
 
 		 319 aa  135  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  30.11 
 
 		 279 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  29.52 
 
 		 317 aa  132  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  30.61 
 
 		 277 aa  132  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  30.25 
 
 		 311 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  31.16 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  31.16 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  31.79 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  31.44 
 
 		 285 aa  129  7.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  32.93 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1412  beta-lactamase domain protein  31.07 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270255  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  29.17 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  29.84 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>