More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1719 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1719  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  294  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.266415  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18361  ATPase or kinase  95.17 
 
 
145 aa  283  7e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.130336  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18181  ATPase or kinase  92.41 
 
 
145 aa  275  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18151  ATPase or kinase  77.78 
 
 
145 aa  231  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.343625  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0145  hypothetical protein  47.52 
 
 
166 aa  144  5e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550915  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01741  ATPase or kinase  46.94 
 
 
172 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17521  ATPase or kinase  46.9 
 
 
170 aa  134  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20781  ATPase or kinase  45.8 
 
 
174 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1203  hypothetical protein  43.8 
 
 
174 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0101  hypothetical protein  46.81 
 
 
163 aa  123  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.286215  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  40.14 
 
 
158 aa  104  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0118  hypothetical protein  43.07 
 
 
152 aa  100  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.927124 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  40 
 
 
152 aa  100  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  44.25 
 
 
153 aa  99.4  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  39.42 
 
 
154 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  34.48 
 
 
152 aa  94  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  43.52 
 
 
159 aa  92.8  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  38.58 
 
 
160 aa  92.8  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  37.12 
 
 
155 aa  92.8  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  43.93 
 
 
160 aa  89.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  37.84 
 
 
165 aa  89  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  36.28 
 
 
152 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  37.78 
 
 
169 aa  87.8  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  40 
 
 
161 aa  87.4  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  37.61 
 
 
161 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  38.14 
 
 
174 aa  87  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  37.07 
 
 
163 aa  87  7e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6009  hypothetical protein  38.6 
 
 
157 aa  87  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  39.53 
 
 
157 aa  87  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0387  hypothetical protein  36.22 
 
 
168 aa  86.7  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.919602  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  38.06 
 
 
161 aa  86.3  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  37.5 
 
 
152 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  37.59 
 
 
153 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3882  protein of unknown function UPF0079  34.72 
 
 
152 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  37.5 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  36.28 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  36.28 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  41.9 
 
 
161 aa  84.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  31.3 
 
 
158 aa  84.3  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  38.98 
 
 
157 aa  84  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  38.98 
 
 
157 aa  84  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  32.33 
 
 
173 aa  84  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  38.98 
 
 
157 aa  84  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  38.98 
 
 
157 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  38.98 
 
 
157 aa  84  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  36.97 
 
 
153 aa  84  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  39.32 
 
 
157 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  38.98 
 
 
157 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  37.5 
 
 
153 aa  83.6  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  38.98 
 
 
157 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0626  hypothetical protein  48.1 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0824  hypothetical protein  39.82 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0786574  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  38.14 
 
 
157 aa  82  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  30.08 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  34.13 
 
 
147 aa  82  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0046  hypothetical protein  34.31 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  37.17 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  35.14 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  37.19 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  36.09 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  38.53 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04610  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  37.14 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.343919 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  36.09 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  38.61 
 
 
164 aa  80.1  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  37.84 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  37.38 
 
 
141 aa  80.1  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  34.26 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  39.45 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  35.92 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  31.75 
 
 
187 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  35.94 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0008  P-loop hydrolase family protein  34.56 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.00000890288  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  37.5 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1143  protein of unknown function UPF0079  35.38 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216548  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  41.9 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0369  protein of unknown function UPF0079  32.8 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0033  protein of unknown function UPF0079  32.85 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  44.04 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  36.43 
 
 
163 aa  77  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  35.16 
 
 
176 aa  77  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  33.86 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2896  protein of unknown function UPF0079  37.11 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.166162  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  36.72 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07470  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  31.4 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.565446  normal  0.131404 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  31.01 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  29.86 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  40.91 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  33.1 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  34.27 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  32.09 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0974  protein of unknown function UPF0079  33.59 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000133858  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2508  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0224892  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  33.94 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  33.86 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6124  protein of unknown function UPF0079  35.4 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433891  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  37.62 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  34.48 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  34.48 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  36.84 
 
 
161 aa  73.6  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  33.03 
 
 
152 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>