More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0824 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0824  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  321  2e-87  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0786574  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1719  hypothetical protein  39.82 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.266415  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18181  ATPase or kinase  39.29 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  43.57 
 
 
187 aa  80.5  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18361  ATPase or kinase  38.05 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.130336  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  34.43 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  43.4 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  43.12 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  33.57 
 
 
174 aa  77  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  42.2 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  36.13 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  38.76 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  37.67 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  36.17 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  41.75 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  43.12 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  32.87 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  42.15 
 
 
188 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  39.57 
 
 
189 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  41.32 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  37.88 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  39.81 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  41.75 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0090  protein of unknown function UPF0079  34.29 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  43.14 
 
 
540 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  41.32 
 
 
183 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  37.68 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  37.68 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  37.68 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  37.68 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4174  hypothetical protein  35.29 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0666  protein of unknown function UPF0079  37.27 
 
 
523 aa  72  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  42.45 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  36.43 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  35.65 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18151  ATPase or kinase  38.53 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.343625  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4062  hypothetical protein  34.88 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  34.81 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  40.95 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  33.81 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  42.2 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  39.29 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  42.45 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  41.94 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0383  hypothetical protein  35.88 
 
 
506 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  40 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1987  hypothetical protein  38.33 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  35.56 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  40.78 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  32.09 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  32.85 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  32.48 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  42.34 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  31.91 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  41.28 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  36 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  39.81 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0587  hypothetical protein  38.46 
 
 
562 aa  67.4  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2797  hypothetical protein  41.41 
 
 
472 aa  67.4  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  33.99 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  33.99 
 
 
161 aa  67  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  36.05 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  36.05 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  34.53 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0095  hypothetical protein  35.97 
 
 
146 aa  67  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442138  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  36.94 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  37.74 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  39.62 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  37.74 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  36.05 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4431  hypothetical protein  41.18 
 
 
549 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.319947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4895  protein of unknown function UPF0079  41.18 
 
 
542 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582734  normal  0.663902 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  35.37 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  36.05 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  36.05 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  37.76 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  36.05 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  33.58 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  33.58 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0492  protein of unknown function UPF0079  44.71 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.069952  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3297  hypothetical protein  38.74 
 
 
523 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.480432 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  33.58 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  33.09 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  36.05 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  36.52 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  36.05 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  35.1 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  38.46 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  40.54 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  34.75 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1157  hypothetical protein  35.65 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  40.35 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  34.53 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  34.45 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1355  P-loop hydrolase/phosphotransferase  36.89 
 
 
497 aa  64.7  0.0000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0569  hypothetical protein  41.75 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000405356 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  36.76 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  33.56 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  34.96 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>