104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_64341 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009048  PICST_64341  GTP-binding protein of the ras family  100 
 
 
182 aa  375  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08868  hypothetical protein similar to small GTPase RAS2 (Broad)  62.09 
 
 
187 aa  234  3e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000000107682 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03660  RHEB small monomeric GTPase, putative  45.4 
 
 
189 aa  173  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.99887  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9927  predicted protein  45.12 
 
 
191 aa  154  6e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00528881  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00182  Ras-like protein Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12526]  44.3 
 
 
212 aa  144  6e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326339  normal  0.668577 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44586  predicted protein  41.82 
 
 
178 aa  140  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.395695  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02810  RAS small monomeric GTPase, putative  40.25 
 
 
216 aa  136  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.191225  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01910  conserved hypothetical protein  34.62 
 
 
224 aa  123  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606471  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57530  predicted protein  40 
 
 
237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  39.51 
 
 
206 aa  112  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05832  Ras small monomeric GTPase RasB (AFU_orthologue; AFUA_2G07770)  34.48 
 
 
225 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.065815  normal  0.88422 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04685  RAS small monomeric GTPase (Rsr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08950)  35.62 
 
 
202 aa  107  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01830  RAS1, putative  40.3 
 
 
192 aa  107  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681478  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  32.94 
 
 
203 aa  103  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  37.35 
 
 
211 aa  103  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  37.65 
 
 
203 aa  102  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  36.94 
 
 
207 aa  100  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  36.09 
 
 
213 aa  100  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  32.1 
 
 
203 aa  99.8  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  33.54 
 
 
205 aa  98.6  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0208811 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  32.1 
 
 
205 aa  98.2  6e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  32.72 
 
 
207 aa  97.1  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  31.03 
 
 
201 aa  95.1  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  30.67 
 
 
208 aa  91.7  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  32.78 
 
 
202 aa  90.5  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  31.06 
 
 
208 aa  90.5  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  32.92 
 
 
184 aa  89.7  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03434  RAS small monomeric GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05770)  29.71 
 
 
197 aa  90.1  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.95299  normal  0.679233 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32675  predicted protein  32.37 
 
 
205 aa  88.2  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0848585 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22095  predicted protein  34.18 
 
 
210 aa  85.9  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  29.34 
 
 
214 aa  85.1  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.495831 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21535  predicted protein  33.54 
 
 
236 aa  84  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00590  conserved hypothetical protein  32.92 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0238603  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00347  Ras GTPase similar to RAB11B (Eurofung)  28.9 
 
 
210 aa  82  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29006  predicted protein  31.87 
 
 
280 aa  82.4  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.779358 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12688  predicted protein  31.4 
 
 
212 aa  81.3  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0669113  normal  0.123552 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61694  predicted protein  35.54 
 
 
224 aa  80.9  0.000000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04140  Rho small monomeric GTPase, putative  29.52 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764266  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  32.26 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51511  predicted protein  30.17 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471468  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  29.19 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00089  Small GTPase AvaA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8TGD9]  30.34 
 
 
205 aa  77.8  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33115  predicted protein  30.95 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.26784 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01820  ras-related protein ypt3 (rab), putative  30.56 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2203  small GTP-binding protein  31.21 
 
 
176 aa  77  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14983  predicted protein  30.06 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227158  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63641  Rab5-like GTPase  32.14 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.38675  normal  0.213062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0881  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.86 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.334755  hitchhiker  0.000103971 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68134  predicted protein  30.43 
 
 
220 aa  74.3  0.0000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  28.72 
 
 
233 aa  73.9  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00660  RAB small monomeric GTPase, putative  28.92 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44216  predicted protein  29.09 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3603  small GTP-binding protein  28.57 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.802563 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07487  CD42_CHICK Cell division control protein 42 homolog (G25K GTP-binding protein)MODA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UR50]  24.48 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.358627  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00140  Rho small monomeric GTPase, putative  24.74 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67584  predicted protein  28.92 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0163736 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05740  GTP-binding protein rhoA Precursor (Rho1 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9C3Y4]  23.83 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51244  GTP-binding protein of the rab/ypt family  35.88 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35277  Cell division control protein 42 homolog  22.4 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.378034 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00160  Rho small monomeric GTPase, putative  23 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00283225  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03842  RAB GTPase Ypt5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08040)  27.59 
 
 
218 aa  67  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41392  predicted protein  27.44 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0613331  normal  0.283654 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0080  small GTP-binding protein  29.34 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.561103  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04960  small GTPase, putative  25.38 
 
 
198 aa  64.3  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45361  GTP-binding protein of the rho family  26.46 
 
 
228 aa  63.9  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.381371  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00070  Rho GTPase, putative  25 
 
 
199 aa  62.4  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.261976  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04330  signal transducer, putative  25.84 
 
 
230 aa  61.6  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00186621  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40058  predicted protein  25.29 
 
 
198 aa  61.2  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0532739  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00920  Rab family GTP-binding protein, putative  29.37 
 
 
885 aa  61.2  0.000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04743  RacA (Eurofung)  23.59 
 
 
199 aa  60.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0182808  normal  0.0388003 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04915  RAB GTPase Vps21/Ypt51, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10740)  25.38 
 
 
258 aa  60.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35392  GTP-binding protein, rho subfamily  25.44 
 
 
199 aa  60.8  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0874099  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  31.62 
 
 
252 aa  60.1  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02630  Rho1 GTPase  22.22 
 
 
216 aa  58.2  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822258  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_51199  predicted protein  25.95 
 
 
237 aa  58.2  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02687  GTP-binding protein rhoC Precursor (Rho3 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96WY0]  22.6 
 
 
280 aa  57.4  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68960  GTP-binding protein (RHO4)  26.11 
 
 
341 aa  56.2  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0983482  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02285  hypothetical protein  27.65 
 
 
161 aa  56.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88308  predicted protein  24.54 
 
 
183 aa  55.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.359872 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62699  predicted protein  28.05 
 
 
199 aa  55.5  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.1708  normal  0.632986 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07206  GTP binding protein (SPG1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10330)  27.06 
 
 
314 aa  54.3  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.214538  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79030  Ras-related small GTPase, Rho type  25 
 
 
186 aa  53.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.554484  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41856  predicted protein  25.32 
 
 
220 aa  52.8  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00446099  hitchhiker  0.00310862 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02474  ras-like GTP-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03100)  28.69 
 
 
307 aa  51.2  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03625  small GTP-binding protein  24.69 
 
 
161 aa  51.2  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04953  hypothetical protein similar to Rho GTPases (Eurofung)  23.39 
 
 
199 aa  50.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02000  GTPase, putative  31.78 
 
 
175 aa  50.1  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01660  small monomeric GTPase, putative  25.54 
 
 
193 aa  49.7  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90151  possible rho-like GTPase involved in secretory vesicle transport  28.24 
 
 
680 aa  49.7  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.907201 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3991  small GTP-binding protein  25.9 
 
 
167 aa  49.3  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82174  RHO small monomeric GTPase signal transduction  21.84 
 
 
226 aa  49.7  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.160342 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04782  hypothetical protein similar to Rho GTPases (Eurofung)  31.01 
 
 
161 aa  48.9  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.936481  normal  0.629565 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05106  secretion related GTPase SrgD (AFU_orthologue; AFUA_1G07680)  26.05 
 
 
175 aa  48.5  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00933055 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04210  conserved hypothetical protein  21.12 
 
 
182 aa  48.1  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84260  predicted protein  22.81 
 
 
214 aa  47.8  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51169  predicted protein  22.44 
 
 
213 aa  48.1  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52636  GTP-binding protein of the rab family  25.57 
 
 
230 aa  47.4  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43276  predicted protein  24.26 
 
 
186 aa  45.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.348621 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43397  predicted protein  24.26 
 
 
186 aa  45.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03934  ADP-ribosylation factor family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08290)  23.27 
 
 
179 aa  45.1  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>