72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_52962 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_52962  Autophagy-related protein 18  100 
 
 		 563 aa  1154    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00127  Autophagy-related protein 18 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH53]  35.83 
 
 		 429 aa  292  9e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02750  autophagy-related protein, putative  47.21 
 
 		 423 aa  269  8e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_3284  predicted protein  33.56 
 
 		 351 aa  160  5e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14477  predicted protein  32.98 
 
 		 248 aa  149  9e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62474  Autophagy-related protein 21  29.5 
 
 		 552 aa  133  7.999999999999999e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.949866 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41442  predicted protein  28.47 
 
 		 254 aa  121  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.315035  normal  0.856804 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04666  SVP1-like protein 2 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B464]  31.93 
 
 		 317 aa  107  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0913318  normal  0.526754 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_4679  SVP1-like protein 2  27.87 
 
 		 423 aa  106  9e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  24.86 
 
 		 947 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  28.57 
 
 		 1188 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  28.95 
 
 		 742 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01780  conserved hypothetical protein  21.9 
 
 		 550 aa  55.1  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0761011  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  28.11 
 
 		 1236 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  38.71 
 
 		 1552 aa  54.3  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  28.57 
 
 		 1363 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  28.45 
 
 		 1188 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.14 
 
 		 642 aa  53.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  24.29 
 
 		 1247 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  30.69 
 
 		 589 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  31.11 
 
 		 443 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  29.17 
 
 		 696 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  24.6 
 
 		 1357 aa  50.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  26.47 
 
 		 1193 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  29.21 
 
 		 1474 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  28.07 
 
 		 1163 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.37 
 
 		 1607 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0693  WD-40 repeat protein  27.37 
 
 		 363 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00188435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  24.5 
 
 		 1157 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0674  WD-40 repeat protein  27.37 
 
 		 363 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.58 
 
 		 596 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  23.37 
 
 		 1454 aa  48.5  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00292  transcription initiation factor TFIID subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03070)  29.67 
 
 		 606 aa  48.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00299159  normal  0.644069 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  32.98 
 
 		 1161 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.57 
 
 		 1626 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  32.98 
 
 		 1161 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  29.21 
 
 		 782 aa  47.8  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3932  WD-40 repeat-containing protein  27.97 
 
 		 914 aa  47.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237365  unclonable  0.0000634097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2962  cytochrome c class I  30.3 
 
 		 448 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.05 
 
 		 1599 aa  47.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  27.17 
 
 		 1196 aa  47  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.26 
 
 		 1004 aa  47.4  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  25.49 
 
 		 1213 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  25.48 
 
 		 1190 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  32.47 
 
 		 1304 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.19 
 
 		 1652 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0987  Serine/threonine protein kinase-related protein  25 
 
 		 842 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466827  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  23.68 
 
 		 774 aa  47  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  31.18 
 
 		 1878 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 687 aa  45.8  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.23 
 
 		 792 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  30 
 
 		 790 aa  45.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46672  WD repeat protein  31.07 
 
 		 317 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  27.17 
 
 		 1097 aa  45.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  25.55 
 
 		 1901 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.47 
 
 		 676 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  26.32 
 
 		 1242 aa  45.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  27.34 
 
 		 1217 aa  45.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.63 
 
 		 740 aa  45.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.88 
 
 		 1547 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.12 
 
 		 1684 aa  45.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.14 
 
 		 576 aa  44.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  25 
 
 		 522 aa  44.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  30.43 
 
 		 564 aa  44.7  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  31.03 
 
 		 1348 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.63 
 
 		 1598 aa  43.9  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.25 
 
 		 630 aa  44.3  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.87 
 
 		 930 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  25.64 
 
 		 1190 aa  43.9  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.51 
 
 		 1711 aa  43.5  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.96 
 
 		 1686 aa  43.9  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4246  WD-40 repeat-containing protein  26.22 
 
 		 958 aa  43.5  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.713375  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>