32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_14477 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_14477  predicted protein  100 
 
 		 248 aa  510  1e-144  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_3284  predicted protein  48.59 
 
 		 351 aa  244  6.999999999999999e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52962  Autophagy-related protein 18  32.98 
 
 		 563 aa  150  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02750  autophagy-related protein, putative  35.09 
 
 		 423 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_4679  SVP1-like protein 2  35.53 
 
 		 423 aa  138  8.999999999999999e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00127  Autophagy-related protein 18 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH53]  32.83 
 
 		 429 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04666  SVP1-like protein 2 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B464]  37.56 
 
 		 317 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0913318  normal  0.526754 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41442  predicted protein  36.48 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.315035  normal  0.856804 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01780  conserved hypothetical protein  24.65 
 
 		 550 aa  75.5  0.0000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0761011  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62474  Autophagy-related protein 21  32.29 
 
 		 552 aa  59.7  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.949866 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  29.57 
 
 		 1188 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3932  WD-40 repeat-containing protein  28.95 
 
 		 914 aa  48.9  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237365  unclonable  0.0000634097 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  35.37 
 
 		 1247 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  28.97 
 
 		 1878 aa  47.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  26.76 
 
 		 1401 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  32.18 
 
 		 1491 aa  45.8  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.03 
 
 		 1004 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  27.45 
 
 		 657 aa  43.5  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  32.47 
 
 		 316 aa  43.5  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.67 
 
 		 682 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  34.88 
 
 		 1217 aa  43.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  35.16 
 
 		 1901 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0674  WD-40 repeat protein  30.61 
 
 		 363 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0693  WD-40 repeat protein  30.61 
 
 		 363 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00188435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15280  predicted protein  35.53 
 
 		 534 aa  42.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  35.16 
 
 		 316 aa  42.7  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  36.36 
 
 		 675 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  34.74 
 
 		 1190 aa  42.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  31.33 
 
 		 1330 aa  42.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  25.42 
 
 		 1193 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  28.41 
 
 		 1163 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12028  predicted protein  39.68 
 
 		 618 aa  42  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>