55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_3284 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009360  OSTLU_3284  predicted protein  100 
 
 
351 aa  719    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14477  predicted protein  48.59 
 
 
248 aa  245  9e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02750  autophagy-related protein, putative  31.27 
 
 
423 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04666  SVP1-like protein 2 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B464]  41.9 
 
 
317 aa  172  9e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0913318  normal  0.526754 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00127  Autophagy-related protein 18 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BH53]  32.98 
 
 
429 aa  166  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_4679  SVP1-like protein 2  38.77 
 
 
423 aa  164  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52962  Autophagy-related protein 18  33.56 
 
 
563 aa  161  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41442  predicted protein  39.44 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.315035  normal  0.856804 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01780  conserved hypothetical protein  31.23 
 
 
550 aa  125  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0761011  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  23.9 
 
 
443 aa  63.2  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62474  Autophagy-related protein 21  36.17 
 
 
552 aa  60.8  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.949866 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  23.17 
 
 
344 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.32 
 
 
1686 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  22.05 
 
 
1221 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.11 
 
 
740 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  22.22 
 
 
1510 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46672  WD repeat protein  22.35 
 
 
317 aa  50.4  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  35.16 
 
 
1878 aa  49.7  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  20.45 
 
 
1208 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  26.53 
 
 
1193 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  21.65 
 
 
696 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  22.38 
 
 
1807 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  20.4 
 
 
1481 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  26.63 
 
 
344 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  25.79 
 
 
1217 aa  47  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  23.53 
 
 
578 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.71 
 
 
675 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3865  WD-40 repeat protein  23.77 
 
 
371 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4252  WD-40 repeat-containing protein  31.48 
 
 
1424 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501692  normal  0.871737 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3914  WD-40 repeat protein  23.77 
 
 
366 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152653  normal  0.245593 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  35.48 
 
 
316 aa  46.2  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  23.73 
 
 
1553 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  30.22 
 
 
872 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  24.8 
 
 
1901 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  24.45 
 
 
1357 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0693  WD-40 repeat protein  26.61 
 
 
363 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00188435  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  24.9 
 
 
1209 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  24.04 
 
 
1161 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  21.69 
 
 
1163 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0674  WD-40 repeat protein  26.61 
 
 
363 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  27.42 
 
 
922 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  24.86 
 
 
342 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0547  WD-40 repeat protein  38.81 
 
 
477 aa  44.3  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  27.91 
 
 
1652 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  24.04 
 
 
1161 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.42 
 
 
664 aa  43.5  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6487  WD-40 repeat-containing protein  35.05 
 
 
780 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  22.53 
 
 
346 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  23.98 
 
 
565 aa  43.5  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  23.02 
 
 
464 aa  43.1  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  21.05 
 
 
947 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.27 
 
 
1557 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  26.72 
 
 
782 aa  43.1  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  31.87 
 
 
434 aa  42.7  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  38.96 
 
 
577 aa  42.7  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>