More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_38202 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_38202  epoxide hydrolase, soluble (sEH)  100 
 
 		 321 aa  667    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.927116  normal  0.566303 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54746  soluble epoxide hydrolase  94.39 
 
 		 321 aa  615  1e-175  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 		 305 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  29.76 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 		 281 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11147  epoxide hydrolase ephC  28.18 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4086  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.339898  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4316  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4162  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.573182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  25.96 
 
 		 301 aa  90.5  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0714  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 306 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0301539  normal  0.0245198 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  25.98 
 
 		 287 aa  89.7  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  25.82 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3248  EphC  25.26 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0191  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  24.76 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  24.76 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  23.51 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  25.89 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  25.89 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  23.43 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  25.89 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  25.89 
 
 		 296 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  25.89 
 
 		 296 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  25.89 
 
 		 296 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  25.89 
 
 		 296 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2990  alpha/beta hydrolase fold protein  22.65 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  hitchhiker  0.00172435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  23.88 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  23.08 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  23.32 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  25.58 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  24.22 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  24.13 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  24.57 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  27.01 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  21.21 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  23.26 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  24.21 
 
 		 308 aa  67  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  22.53 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  24.75 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  26.2 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  22.65 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  23.26 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  25.9 
 
 		 317 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  23.36 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  24.28 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  23.86 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.53 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287872  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  23.36 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  23.36 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  25.34 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  25.34 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3859  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  23.44 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  21.6 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  21.6 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  23.26 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  21.6 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  21.6 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  24.67 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  21.6 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  21.6 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  21.6 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  23.26 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1129  alpha/beta hydrolase fold protein  23.75 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  22.46 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  21.85 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  24.37 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5726  alpha/beta hydrolase fold protein  24.56 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  22.73 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  23.59 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  23.36 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3635  alpha/beta hydrolase fold protein  22.34 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2687  putative epoxide hydrolase  22.61 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  25.36 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  23.47 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  23.65 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  22.03 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  23.43 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1437  alpha/beta hydrolase fold protein  22.64 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>