More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_29666 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_29666  short-chain alcohol dehydrogenase  100 
 
 
338 aa  706    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.62197 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81469  short-chain alcohol dehydrogenase retinol dehydrogenase Protochlorophyllide reductase  63.77 
 
 
334 aa  422  1e-117  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.761909  normal  0.570556 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03226  conserved hypothetical protein  36.36 
 
 
312 aa  175  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10815  conserved hypothetical protein  34.65 
 
 
323 aa  168  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07339  conserved hypothetical protein  32.63 
 
 
359 aa  168  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.201379  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05270  AY086643 putativepod-specific dehydrogenase SAC25, putative  31.1 
 
 
364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  35.42 
 
 
737 aa  144  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  37.05 
 
 
329 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10514  short-chain dehydrogenase/reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02770)  32.2 
 
 
349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  32.73 
 
 
316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.45 
 
 
303 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.9 
 
 
326 aa  109  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 
307 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.27 
 
 
303 aa  109  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08603  conserved hypothetical protein  31.75 
 
 
417 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 
322 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.55 
 
 
325 aa  106  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  30.45 
 
 
300 aa  105  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  31.14 
 
 
324 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.33 
 
 
305 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.86 
 
 
304 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
326 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  28.03 
 
 
300 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  28.95 
 
 
320 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.93 
 
 
316 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
307 aa  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.55 
 
 
298 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  30.32 
 
 
300 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
320 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 
306 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03305  short chain dehydrogenase/reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14310)  26.94 
 
 
331 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  28.12 
 
 
311 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  29.56 
 
 
302 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  32.25 
 
 
319 aa  99.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  33.1 
 
 
305 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.49 
 
 
341 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02813  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_2G04560)  32.32 
 
 
268 aa  97.4  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000285176  normal  0.115904 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.25 
 
 
305 aa  97.4  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  hitchhiker  0.00451656 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.64 
 
 
327 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.31 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.59 
 
 
312 aa  97.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 
310 aa  97.1  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  29.68 
 
 
300 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.61 
 
 
287 aa  96.7  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.77 
 
 
324 aa  96.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  29.68 
 
 
300 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  31.07 
 
 
305 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.95 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 
312 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  29.87 
 
 
320 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  28.77 
 
 
301 aa  94  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.69 
 
 
333 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  29.47 
 
 
299 aa  93.6  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.86 
 
 
318 aa  93.6  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.85 
 
 
298 aa  92.8  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.3 
 
 
312 aa  92.8  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.41 
 
 
324 aa  92.8  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  31.16 
 
 
321 aa  92.8  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  30.14 
 
 
309 aa  92.4  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35460  predicted protein  29.75 
 
 
301 aa  91.7  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88990  predicted protein  28.09 
 
 
363 aa  92.4  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89854  predicted protein  28.09 
 
 
363 aa  92.4  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.264825  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00455  probable oxidoreductase  29.58 
 
 
318 aa  92  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 
323 aa  92.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.88 
 
 
340 aa  91.7  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00109277  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  31.21 
 
 
306 aa  91.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  28.67 
 
 
317 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.77 
 
 
319 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  30.61 
 
 
306 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.03 
 
 
331 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.5 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.14 
 
 
298 aa  90.5  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  32.08 
 
 
284 aa  90.5  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.53 
 
 
315 aa  90.1  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  30.61 
 
 
306 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.63 
 
 
311 aa  89.7  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  30.61 
 
 
306 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  28.21 
 
 
302 aa  89.7  7e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
313 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.89 
 
 
298 aa  89.4  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.94 
 
 
304 aa  89.4  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  29.33 
 
 
303 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  28.97 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.93 
 
 
331 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  28.72 
 
 
309 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  27.69 
 
 
304 aa  88.2  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.3 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.21 
 
 
297 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.87 
 
 
315 aa  87.4  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
298 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.64 
 
 
308 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.0102569 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01783  short-chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00280)  29.62 
 
 
661 aa  86.7  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0309502 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  28.62 
 
 
309 aa  86.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
320 aa  85.9  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.67 
 
 
290 aa  85.9  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.18 
 
 
331 aa  85.9  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86463  predicted protein  29.25 
 
 
334 aa  85.9  9e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
314 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.39 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  26.5 
 
 
303 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>