More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_32916 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_32916  predicted protein  100 
 
 		 252 aa  526  1e-149  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2311  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase, TIGR01548  35.86 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17051  putative imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  25.59 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.426884  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0531  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.498343  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12741  putative imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  28.57 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.281535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.81 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3452  HAD family hydrolase  29.84 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.23904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1886  HAD superfamily hydrolase  27.8 
 
 		 263 aa  67  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.98 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  35.4 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0466  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase, TIGR01548  27.23 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0844788  normal  0.0854988 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  25.62 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  36.08 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0820  HAD family hydrolase  36.27 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0305  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase, TIGR01548  24.9 
 
 		 293 aa  62  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.741763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  27.18 
 
 		 216 aa  62  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.29 
 
 		 219 aa  62  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00300829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  25.5 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1504  HAD family hydrolase  36.46 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  27.18 
 
 		 223 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  25.85 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.7 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  26.47 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  26.47 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  29.06 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  28.92 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15601  putative imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  27.69 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1352  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.11 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000681054  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.01 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  32.28 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2346  HAD family hydrolase  27.2 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.470846 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  41.49 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2262  hydrolase  32.43 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  28.43 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  27.86 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  27.86 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0854  HAD family hydrolase  33.01 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249022  decreased coverage  0.000200034 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  28.35 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  26.47 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1064  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.29 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  40.38 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  27.8 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1618  putative imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  26.51 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0625  HAD family hydrolase  32.76 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  23 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  23 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  34.78 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  25.63 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  23 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  23 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  23 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  23 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1189  HAD family hydrolase  26.55 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  23 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1555  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase, TIGR01548  23.51 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  27.14 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1448  HAD family hydrolase  28 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0334777 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4110  HAD superfamily hydrolase  26.46 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  25.98 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04971  putative imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  25.82 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22171  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  33.66 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4662  HAD family hydrolase  29.85 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00548431  decreased coverage  0.00277532 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  24.88 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  26.11 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  27.23 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1018  HAD family hydrolase  30.08 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76802 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1759  hydrolase  27.36 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1346  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.57 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  27.94 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  25.13 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0340  HAD superfamily hydrolase  27.23 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.369886  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  25.13 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  25.13 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17181  putative imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  24.6 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  24.18 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  25.13 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  25.13 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0328  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase, TIGR01548  25.21 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1575  phosphoglycolate phosphatase  26.8 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.099799  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2174  HAD family hydrolase  29.1 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21673  normal  0.110893 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17301  putative imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  25.3 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0391  HAD family hydrolase  31.43 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0335  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase, TIGR01548  25.1 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0232711 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  25.71 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  25.71 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2291  HAD family hydrolase  32.98 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.265516  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  25.36 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  25.71 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1175  HAD family hydrolase  30.43 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  27.06 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6369  HAD family hydrolase  27.7 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23133  normal  0.167912 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  25.25 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1323  HAD family hydrolase  30.93 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00010916  normal  0.934661 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  26.26 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  25.36 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.98 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  25.36 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>