More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0683 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0683  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 
788 aa  1619    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0106782 
 
 
-
 
NC_002950  PG0682  ABC transporter, permease protein, putative  33.21 
 
 
783 aa  420  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0231901 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  27.22 
 
 
793 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  27.31 
 
 
805 aa  308  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3433  protein of unknown function DUF214  26.97 
 
 
809 aa  307  6e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560491  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  28.05 
 
 
795 aa  303  8.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3637  protein of unknown function DUF214  26.95 
 
 
834 aa  301  5e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000286021  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  26.53 
 
 
811 aa  300  7e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2206  protein of unknown function DUF214  27.22 
 
 
777 aa  295  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  27.24 
 
 
792 aa  294  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  25.79 
 
 
804 aa  285  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  26.49 
 
 
793 aa  285  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  27.94 
 
 
798 aa  282  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4615  protein of unknown function DUF214  27.34 
 
 
807 aa  281  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4595  protein of unknown function DUF214  26.43 
 
 
800 aa  281  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4614  protein of unknown function DUF214  27.99 
 
 
801 aa  278  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.122129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1539  protein of unknown function DUF214  25.82 
 
 
804 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  25.42 
 
 
808 aa  272  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1753  protein of unknown function DUF214  26.84 
 
 
801 aa  273  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4843  protein of unknown function DUF214  24.94 
 
 
786 aa  272  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  26.21 
 
 
811 aa  270  5.9999999999999995e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0960  protein of unknown function DUF214  27.06 
 
 
803 aa  270  8.999999999999999e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000834077  normal  0.437277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  27.2 
 
 
793 aa  270  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0958  protein of unknown function DUF214  26.13 
 
 
797 aa  269  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00075656  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5545  protein of unknown function DUF214  25.79 
 
 
788 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.366096  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  25.95 
 
 
805 aa  267  5.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  25.93 
 
 
810 aa  266  8.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  27.21 
 
 
816 aa  266  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  25.33 
 
 
797 aa  266  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2853  protein of unknown function DUF214  25.8 
 
 
792 aa  264  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317184  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5675  protein of unknown function DUF214  24.42 
 
 
789 aa  261  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0935  protein of unknown function DUF214  25.9 
 
 
785 aa  261  5.0000000000000005e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  25.86 
 
 
770 aa  261  5.0000000000000005e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  26.21 
 
 
795 aa  261  5.0000000000000005e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  25.03 
 
 
806 aa  259  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4368  protein of unknown function DUF214  25.21 
 
 
800 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.129517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2744  protein of unknown function DUF214  26.41 
 
 
799 aa  258  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2084  protein of unknown function DUF214  26.67 
 
 
801 aa  257  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.326443  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1450  protein of unknown function DUF214  25.98 
 
 
789 aa  256  8e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.264856  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0944  protein of unknown function DUF214  26.07 
 
 
803 aa  256  9e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.74129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  24.76 
 
 
784 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4630  protein of unknown function DUF214  24.94 
 
 
816 aa  254  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  26.52 
 
 
790 aa  254  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  25.63 
 
 
805 aa  252  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0928  protein of unknown function DUF214  26.28 
 
 
800 aa  251  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  24.43 
 
 
813 aa  250  7e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6082  protein of unknown function DUF214  26.59 
 
 
802 aa  250  8e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165381  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4627  protein of unknown function DUF214  25.57 
 
 
795 aa  249  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4861  protein of unknown function DUF214  25.88 
 
 
798 aa  246  9e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4847  protein of unknown function DUF214  26.18 
 
 
818 aa  244  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.119483  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  25.3 
 
 
804 aa  243  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4610  protein of unknown function DUF214  25.68 
 
 
798 aa  242  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.22275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3271  protein of unknown function DUF214  24.69 
 
 
795 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  0.0322761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4899  protein of unknown function DUF214  25.03 
 
 
802 aa  241  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000216897  normal  0.089059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2156  protein of unknown function DUF214  26.77 
 
 
797 aa  240  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.702076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0946  protein of unknown function DUF214  24.04 
 
 
811 aa  240  8e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0636154  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4121  protein of unknown function DUF214  26.32 
 
 
789 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0606813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  24.94 
 
 
802 aa  239  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0932  protein of unknown function DUF214  25.72 
 
 
816 aa  240  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3701  protein of unknown function DUF214  26.13 
 
 
814 aa  238  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000785399  unclonable  0.0000000000000250396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0957  protein of unknown function DUF214  25.09 
 
 
785 aa  238  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439448  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1215  protein of unknown function DUF214  23.21 
 
 
791 aa  237  8e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4622  protein of unknown function DUF214  25.52 
 
 
802 aa  236  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.498775 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7257  protein of unknown function DUF214  25.61 
 
 
798 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506744  normal  0.498638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4858  protein of unknown function DUF214  25.12 
 
 
809 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0512952 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  24.69 
 
 
809 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  24.39 
 
 
788 aa  233  8.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4619  protein of unknown function DUF214  26.17 
 
 
817 aa  228  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0658  protein of unknown function DUF214  23.26 
 
 
793 aa  226  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442095  normal  0.737711 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1806  protein of unknown function DUF214  23.06 
 
 
790 aa  223  7e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4859  protein of unknown function DUF214  24.17 
 
 
792 aa  223  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0508357 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0943  protein of unknown function DUF214  24.73 
 
 
802 aa  222  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2089  protein of unknown function DUF214  23.95 
 
 
794 aa  221  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4494  protein of unknown function DUF214  23.28 
 
 
784 aa  220  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0599884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3658  protein of unknown function DUF214  24.2 
 
 
803 aa  220  7.999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0492574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4621  protein of unknown function DUF214  26.16 
 
 
791 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0925  protein of unknown function DUF214  23.15 
 
 
794 aa  218  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4642  protein of unknown function DUF214  23.59 
 
 
801 aa  217  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000162597  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4607  protein of unknown function DUF214  25.21 
 
 
811 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.727239 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2464  protein of unknown function DUF214  25.45 
 
 
792 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427191  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  23.73 
 
 
800 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0929  protein of unknown function DUF214  24.97 
 
 
791 aa  212  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4850  protein of unknown function DUF214  23.82 
 
 
791 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0898255  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1651  protein of unknown function DUF214  23.53 
 
 
800 aa  208  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.9714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1760  protein of unknown function DUF214  25.85 
 
 
798 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962231  normal  0.806233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0472  hypothetical protein  23.52 
 
 
807 aa  206  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0927  protein of unknown function DUF214  23.45 
 
 
797 aa  204  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3774  protein of unknown function DUF214  25.42 
 
 
791 aa  202  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779669  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1329  hypothetical protein  23.89 
 
 
809 aa  199  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0330  acetylornithine deacetylase ArgE  23.62 
 
 
835 aa  196  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.277971 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0473  hypothetical protein  24.67 
 
 
807 aa  196  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4639  protein of unknown function DUF214  25.21 
 
 
791 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2599  protein of unknown function DUF214  24.13 
 
 
812 aa  183  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4618  protein of unknown function DUF214  23.91 
 
 
808 aa  182  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.154299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3764  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
714 aa  179  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3765  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
801 aa  177  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.709243  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4700  ABC transporter, permease protein  22.59 
 
 
836 aa  173  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2954  protein of unknown function DUF214  24.7 
 
 
803 aa  171  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0955  protein of unknown function DUF214  22.84 
 
 
799 aa  168  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4616  protein of unknown function DUF214  26.17 
 
 
807 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.413807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>