More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0955 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0955  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
799 aa  1638    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4607  protein of unknown function DUF214  42.87 
 
 
811 aa  654    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.727239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0943  protein of unknown function DUF214  38.81 
 
 
802 aa  556  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3765  protein of unknown function DUF214  38.56 
 
 
801 aa  552  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.709243  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  30 
 
 
793 aa  363  8e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  31.23 
 
 
805 aa  362  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  30.56 
 
 
810 aa  347  7e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  30.63 
 
 
813 aa  343  5.999999999999999e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  29.72 
 
 
795 aa  343  8e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  30.23 
 
 
797 aa  339  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  30.14 
 
 
811 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4847  protein of unknown function DUF214  29.95 
 
 
818 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.119483  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  29.79 
 
 
792 aa  337  7e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1753  protein of unknown function DUF214  31.51 
 
 
801 aa  335  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4615  protein of unknown function DUF214  30.89 
 
 
807 aa  334  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1539  protein of unknown function DUF214  29.38 
 
 
804 aa  332  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0935  protein of unknown function DUF214  27.92 
 
 
785 aa  331  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4850  protein of unknown function DUF214  30.75 
 
 
791 aa  328  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0898255  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4622  protein of unknown function DUF214  31.11 
 
 
802 aa  328  4.0000000000000003e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.498775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  28.9 
 
 
784 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2206  protein of unknown function DUF214  28.79 
 
 
777 aa  325  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4614  protein of unknown function DUF214  29.65 
 
 
801 aa  325  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.122129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0958  protein of unknown function DUF214  28.99 
 
 
797 aa  324  4e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00075656  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  29.26 
 
 
795 aa  323  6e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4627  protein of unknown function DUF214  29.23 
 
 
795 aa  322  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  29.65 
 
 
793 aa  320  5e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1450  protein of unknown function DUF214  27.96 
 
 
789 aa  319  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.264856  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4616  protein of unknown function DUF214  28.5 
 
 
807 aa  318  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.413807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5545  protein of unknown function DUF214  27.92 
 
 
788 aa  317  5e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.366096  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4619  protein of unknown function DUF214  30.31 
 
 
817 aa  316  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  29.18 
 
 
805 aa  316  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2744  protein of unknown function DUF214  29.1 
 
 
799 aa  316  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4595  protein of unknown function DUF214  30.6 
 
 
800 aa  314  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1215  protein of unknown function DUF214  29.44 
 
 
791 aa  315  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  28.86 
 
 
816 aa  311  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  28.48 
 
 
770 aa  310  9e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2156  protein of unknown function DUF214  27.59 
 
 
797 aa  309  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.702076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6082  protein of unknown function DUF214  29.69 
 
 
802 aa  310  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165381  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  27.78 
 
 
793 aa  310  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2853  protein of unknown function DUF214  27.98 
 
 
792 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317184  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0960  protein of unknown function DUF214  27.87 
 
 
803 aa  308  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000834077  normal  0.437277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0929  protein of unknown function DUF214  29.35 
 
 
791 aa  307  5.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3433  protein of unknown function DUF214  27.74 
 
 
809 aa  306  8.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560491  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4621  protein of unknown function DUF214  29.42 
 
 
791 aa  305  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0957  protein of unknown function DUF214  28.86 
 
 
785 aa  304  5.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439448  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5675  protein of unknown function DUF214  28.4 
 
 
789 aa  300  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0925  protein of unknown function DUF214  28.93 
 
 
794 aa  299  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4610  protein of unknown function DUF214  28.16 
 
 
798 aa  296  7e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.22275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4630  protein of unknown function DUF214  29.05 
 
 
816 aa  296  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0959  protein of unknown function DUF214  28.59 
 
 
780 aa  295  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000592859  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  27.49 
 
 
802 aa  295  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4861  protein of unknown function DUF214  28.02 
 
 
798 aa  293  6e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  27.36 
 
 
798 aa  293  7e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  27.94 
 
 
804 aa  293  8e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0927  protein of unknown function DUF214  29.6 
 
 
797 aa  293  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4368  protein of unknown function DUF214  28.31 
 
 
800 aa  292  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.129517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1806  protein of unknown function DUF214  27.77 
 
 
790 aa  291  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0944  protein of unknown function DUF214  28.21 
 
 
803 aa  291  4e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.74129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  27.75 
 
 
788 aa  290  7e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2464  protein of unknown function DUF214  28.3 
 
 
792 aa  290  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427191  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4858  protein of unknown function DUF214  27.42 
 
 
809 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0512952 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4642  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 
801 aa  287  5e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000162597  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0658  protein of unknown function DUF214  29.28 
 
 
793 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442095  normal  0.737711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0946  protein of unknown function DUF214  27.32 
 
 
811 aa  286  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0636154  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0330  acetylornithine deacetylase ArgE  26.87 
 
 
835 aa  285  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.277971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0928  protein of unknown function DUF214  28.21 
 
 
800 aa  285  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3271  protein of unknown function DUF214  27.7 
 
 
795 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  0.0322761 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3637  protein of unknown function DUF214  27.06 
 
 
834 aa  283  8.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000286021  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2089  protein of unknown function DUF214  28.26 
 
 
794 aa  283  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4843  protein of unknown function DUF214  27.4 
 
 
786 aa  280  6e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.235798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  26.8 
 
 
790 aa  280  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  27.97 
 
 
809 aa  279  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0932  protein of unknown function DUF214  27.79 
 
 
816 aa  277  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4618  protein of unknown function DUF214  27.76 
 
 
808 aa  276  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.154299 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7257  protein of unknown function DUF214  27.74 
 
 
798 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506744  normal  0.498638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  26.18 
 
 
805 aa  276  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3658  protein of unknown function DUF214  27.26 
 
 
803 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0492574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4494  protein of unknown function DUF214  27.88 
 
 
784 aa  273  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0599884 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3774  protein of unknown function DUF214  27.24 
 
 
791 aa  271  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779669  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  26.44 
 
 
806 aa  271  4e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1804  protein of unknown function DUF214  27.35 
 
 
802 aa  271  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2084  protein of unknown function DUF214  26.98 
 
 
801 aa  271  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.326443  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3701  protein of unknown function DUF214  27.8 
 
 
814 aa  270  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000785399  unclonable  0.0000000000000250396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3610  protein of unknown function DUF214  28.21 
 
 
789 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.251487  hitchhiker  0.000460877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4121  protein of unknown function DUF214  25.33 
 
 
789 aa  266  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0606813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  27.15 
 
 
804 aa  265  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5137  protein of unknown function DUF214  30.02 
 
 
792 aa  263  8e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.11243 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4899  protein of unknown function DUF214  24.49 
 
 
802 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000216897  normal  0.089059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  26.07 
 
 
808 aa  256  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4700  ABC transporter, permease protein  26.8 
 
 
836 aa  254  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  27.29 
 
 
811 aa  254  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1651  protein of unknown function DUF214  24.85 
 
 
800 aa  253  7e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.9714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1760  protein of unknown function DUF214  27.51 
 
 
798 aa  253  8.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962231  normal  0.806233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  26.11 
 
 
800 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0472  hypothetical protein  26.83 
 
 
807 aa  242  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3505  ABC transporter, permease protein  24.64 
 
 
804 aa  237  8e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.084112  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4639  protein of unknown function DUF214  28.45 
 
 
791 aa  236  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1329  hypothetical protein  25.79 
 
 
809 aa  236  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4859  protein of unknown function DUF214  25.12 
 
 
792 aa  233  7.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0508357 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5424  protein of unknown function DUF214  25.18 
 
 
803 aa  232  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00458607  normal  0.0384423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>