117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0896 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  100 
 
 
129 aa  262  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4101  ribonuclease P  57.36 
 
 
127 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4062  ribonuclease P  56.59 
 
 
127 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  50 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3433  ribonuclease P  41.73 
 
 
140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  44.03 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0685  ribonuclease P protein component  41.73 
 
 
140 aa  107  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  38.94 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  35.96 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  35.09 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  35.96 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  35.96 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  35.96 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  35.96 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  35.96 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  35.96 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12711  ribonuclease P protein component  32.06 
 
 
130 aa  63.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373516 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  35.09 
 
 
115 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  29.84 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  34.86 
 
 
115 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1615  ribonuclease P  36 
 
 
122 aa  62  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.166425 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16581  ribonuclease P protein component  32.09 
 
 
128 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  35.09 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  31.93 
 
 
126 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  30.25 
 
 
120 aa  57.4  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  33.62 
 
 
121 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  33.06 
 
 
119 aa  56.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0803  ribonuclease P protein component  30.08 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.530045  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  27.12 
 
 
116 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  33.65 
 
 
116 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03486  ribonuclease P protein component  41.67 
 
 
109 aa  54.3  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  31.25 
 
 
115 aa  54.3  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  31.09 
 
 
120 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  33.65 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  29.31 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13561  ribonuclease P protein component  29.32 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.269036  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  38.68 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  33.65 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1285  ribonuclease P protein component  25.98 
 
 
128 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.240066  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  29.57 
 
 
119 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  29.91 
 
 
121 aa  52  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  32.14 
 
 
124 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  29.84 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  29.46 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  31.53 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  27.97 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  28.57 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  27.35 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  27.35 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13771  ribonuclease P protein component  25.78 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.805452  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  27.35 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  35.48 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  35.96 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27050  predicted protein  42.86 
 
 
164 aa  47.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.121605  hitchhiker  0.000860128 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  35.16 
 
 
125 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  32.14 
 
 
107 aa  47.4  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3076  hypothetical protein  32.65 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  27.97 
 
 
126 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  31.96 
 
 
117 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  31.96 
 
 
117 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  34.21 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  29.67 
 
 
152 aa  46.2  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2932  hypothetical protein  32.65 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  28.07 
 
 
147 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  29.91 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  35.11 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  35.11 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  32.74 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  37.08 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  29.41 
 
 
114 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  35.14 
 
 
106 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  32.22 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  28.57 
 
 
119 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13851  ribonuclease P protein component  24.81 
 
 
128 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.91647  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  40.54 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0356  ribonuclease P protein component  31.9 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274871  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2315  ribonuclease P  34.15 
 
 
121 aa  43.9  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  23.68 
 
 
122 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  33.63 
 
 
137 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3035  ribonuclease P protein component  30.93 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  33.63 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0579  ribonuclease P protein component of ribozyme  27.78 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  25.86 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  26.79 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  26.09 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  31.58 
 
 
180 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  34.29 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  31.96 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  30.85 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002014  ribonuclease P protein component  39.24 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000192203  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1863  RNase P protein component  26.19 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.546361  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  26.27 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0552  ribonuclease P protein component  32.41 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  30.43 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  36.36 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  29.41 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  30.68 
 
 
227 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  28.97 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  29.09 
 
 
240 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0503027 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>