17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1285 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1285  ribonuclease P protein component  100 
 
 
128 aa  261  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.240066  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13771  ribonuclease P protein component  88.28 
 
 
128 aa  233  7e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.805452  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13851  ribonuclease P protein component  88.28 
 
 
128 aa  232  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.91647  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13561  ribonuclease P protein component  70.87 
 
 
129 aa  181  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.269036  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12711  ribonuclease P protein component  38.58 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373516 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0579  ribonuclease P protein component of ribozyme  37.19 
 
 
128 aa  87.4  6e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16581  ribonuclease P protein component  34.38 
 
 
128 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0803  ribonuclease P protein component  33.59 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.530045  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06111  ribonuclease P protein component  35.94 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1785  ribonuclease P protein component of ribozyme  34.71 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.391704  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  25.98 
 
 
129 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0685  ribonuclease P protein component  28.06 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  27.27 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4062  ribonuclease P  28.35 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4101  ribonuclease P  25.2 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3433  ribonuclease P  25.18 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  26.92 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>