49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3433 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3433  ribonuclease P  100 
 
 
140 aa  283  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0685  ribonuclease P protein component  66.43 
 
 
140 aa  189  9e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  52.55 
 
 
131 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  49.28 
 
 
159 aa  134  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  41.73 
 
 
129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4101  ribonuclease P  41.43 
 
 
127 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4062  ribonuclease P  42.86 
 
 
127 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12711  ribonuclease P protein component  30.43 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373516 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1615  ribonuclease P  35.51 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.166425 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  31.25 
 
 
115 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  31.25 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  33.04 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  30.36 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  31.25 
 
 
115 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  29.46 
 
 
119 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  29.46 
 
 
119 aa  50.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  29.46 
 
 
119 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  29.46 
 
 
119 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16581  ribonuclease P protein component  26.81 
 
 
128 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  29.46 
 
 
119 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  29.46 
 
 
115 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  30 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  29.46 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  34.82 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  28.12 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  33.93 
 
 
116 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  33.93 
 
 
116 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0803  ribonuclease P protein component  27.66 
 
 
128 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.530045  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  34.26 
 
 
119 aa  47  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03486  ribonuclease P protein component  39.74 
 
 
109 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1285  ribonuclease P protein component  25.18 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.240066  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4795  hypothetical protein  30.39 
 
 
176 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13561  ribonuclease P protein component  24.83 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.269036  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5052  ribonuclease P protein component  32.33 
 
 
128 aa  44.3  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107995  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5301  hypothetical protein  35.35 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476606  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4142  hypothetical protein  29.17 
 
 
157 aa  43.9  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  30.53 
 
 
120 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  26.67 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4907  hypothetical protein  32.99 
 
 
136 aa  42.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.456888 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0579  ribonuclease P protein component of ribozyme  29.32 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  32.71 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13771  ribonuclease P protein component  22.3 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.805452  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5014  hypothetical protein  36.59 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2315  ribonuclease P  44 
 
 
121 aa  41.2  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2225  ribonuclease P  44 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3544  hypothetical protein  28.57 
 
 
157 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27050  predicted protein  32.41 
 
 
164 aa  40.4  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.121605  hitchhiker  0.000860128 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  36.84 
 
 
137 aa  40.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2557  ribonuclease P protein component  40.98 
 
 
91 aa  40  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000049885  normal  0.280398 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>