19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1785 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1785  ribonuclease P protein component of ribozyme  100 
 
 
128 aa  253  7e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.391704  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0579  ribonuclease P protein component of ribozyme  75.59 
 
 
128 aa  189  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12711  ribonuclease P protein component  44.8 
 
 
130 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373516 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06111  ribonuclease P protein component  59.52 
 
 
128 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16581  ribonuclease P protein component  40.62 
 
 
128 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0803  ribonuclease P protein component  40.62 
 
 
128 aa  100  8e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.530045  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13771  ribonuclease P protein component  33.88 
 
 
128 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.805452  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13561  ribonuclease P protein component  32.54 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.269036  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1285  ribonuclease P protein component  34.71 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.240066  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13851  ribonuclease P protein component  34.71 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.91647  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0685  ribonuclease P protein component  33.08 
 
 
140 aa  53.9  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  28.69 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  34.62 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  29.27 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3433  ribonuclease P  31.16 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4062  ribonuclease P  28.93 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4101  ribonuclease P  31.15 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2778  ribonuclease P protein component  37.31 
 
 
86 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.07678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03486  ribonuclease P protein component  37.33 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>