68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4062 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_4062  ribonuclease P  100 
 
 
127 aa  258  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4101  ribonuclease P  92.13 
 
 
127 aa  244  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  56.59 
 
 
129 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  45.38 
 
 
131 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3433  ribonuclease P  42.86 
 
 
140 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  41.04 
 
 
159 aa  104  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0685  ribonuclease P protein component  44.29 
 
 
140 aa  99  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16581  ribonuclease P protein component  36.51 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  38.68 
 
 
115 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0803  ribonuclease P protein component  35.66 
 
 
128 aa  60.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.530045  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  39.64 
 
 
115 aa  60.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  36.28 
 
 
120 aa  60.5  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  37.84 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  36.94 
 
 
115 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  36.94 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  36.94 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  36.94 
 
 
119 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  36.94 
 
 
119 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  36.94 
 
 
119 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  36.94 
 
 
119 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  36.94 
 
 
119 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5052  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107995  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12711  ribonuclease P protein component  32.28 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373516 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  36.94 
 
 
121 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  33.88 
 
 
121 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  35.23 
 
 
130 aa  51.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1615  ribonuclease P  34.43 
 
 
122 aa  50.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.166425 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  29.51 
 
 
123 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  26.05 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  41.3 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  41.3 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13561  ribonuclease P protein component  29.23 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.269036  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  41.3 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03486  ribonuclease P protein component  37.97 
 
 
109 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  35.56 
 
 
180 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  34.31 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  24.78 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  26.32 
 
 
118 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  26.32 
 
 
118 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  29.7 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  26.32 
 
 
118 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13771  ribonuclease P protein component  36.84 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.805452  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  27.52 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1285  ribonuclease P protein component  28.35 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.240066  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  32.2 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  29.73 
 
 
111 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  31.58 
 
 
131 aa  44.7  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13851  ribonuclease P protein component  38.16 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.91647  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2225  ribonuclease P  29.11 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  24.79 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  28.18 
 
 
115 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  28.93 
 
 
122 aa  43.5  0.0009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  30.91 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  31.43 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  30.91 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  32.97 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  27.27 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3035  ribonuclease P protein component  35.53 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2315  ribonuclease P  28.57 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  29.25 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  26.36 
 
 
107 aa  41.6  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  31.43 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  29.52 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  29.41 
 
 
162 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0008  ribonuclease P  30.56 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000255186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5311  ribonuclease P  30.56 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0346243 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  32.58 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1229  ribonuclease P protein component  28.07 
 
 
122 aa  40.4  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0151351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>