18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_13561 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_13561  ribonuclease P protein component  100 
 
 
129 aa  260  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.269036  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13851  ribonuclease P protein component  70.87 
 
 
128 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.91647  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1285  ribonuclease P protein component  70.87 
 
 
128 aa  181  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.240066  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13771  ribonuclease P protein component  70.08 
 
 
128 aa  181  3e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.805452  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12711  ribonuclease P protein component  39.39 
 
 
130 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373516 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0579  ribonuclease P protein component of ribozyme  34.13 
 
 
128 aa  92.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16581  ribonuclease P protein component  41.09 
 
 
128 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0803  ribonuclease P protein component  40.31 
 
 
128 aa  92  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.530045  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06111  ribonuclease P protein component  35.66 
 
 
128 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1785  ribonuclease P protein component of ribozyme  32.54 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.391704  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0685  ribonuclease P protein component  29.29 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  29.32 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4062  ribonuclease P  29.23 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  29.55 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4101  ribonuclease P  26.92 
 
 
127 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3433  ribonuclease P  24.83 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  26.12 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  28.91 
 
 
162 aa  40.4  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>