195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2934 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  100 
 
 
115 aa  231  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  42.34 
 
 
116 aa  99  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  42.45 
 
 
109 aa  94.4  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  42.45 
 
 
116 aa  94.7  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  44.64 
 
 
126 aa  94  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  40.19 
 
 
121 aa  90.5  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  41.96 
 
 
121 aa  87.4  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  42.48 
 
 
125 aa  87  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  42.48 
 
 
125 aa  87  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  40.37 
 
 
120 aa  85.1  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  39.81 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  35.4 
 
 
113 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  36.79 
 
 
120 aa  73.9  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  35.78 
 
 
119 aa  72  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  36.19 
 
 
111 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  35.4 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  34.62 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  34.62 
 
 
115 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  34.62 
 
 
115 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  34.62 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  34.62 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  34.62 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  34.62 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  38.82 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  34.62 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  34.62 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  34.55 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  31.07 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  34.62 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  36.45 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  39.76 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  33.33 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  32.17 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  43.04 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  34.31 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  34.62 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  33.94 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  29.81 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  31.19 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  33.64 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  31.19 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  35 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  43.02 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52470  ribonuclease P  37.11 
 
 
130 aa  61.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  27.83 
 
 
116 aa  60.8  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  33.96 
 
 
122 aa  60.8  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  39.73 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2237  ribonuclease P protein component  40 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1256  ribonuclease P protein component  32.38 
 
 
115 aa  60.1  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000286956  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  41.25 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  36.17 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  46.15 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  36.08 
 
 
134 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6370  ribonuclease P  36.08 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  36.08 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  31.73 
 
 
118 aa  57.8  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  30.43 
 
 
162 aa  57.4  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  35.71 
 
 
129 aa  57.4  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  34.88 
 
 
116 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  32.69 
 
 
109 aa  57  0.00000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  34.88 
 
 
116 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  28.42 
 
 
117 aa  56.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  32.38 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  32.04 
 
 
117 aa  55.5  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  37.04 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  27.27 
 
 
117 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  48.44 
 
 
109 aa  56.2  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  40.62 
 
 
116 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  31.73 
 
 
123 aa  54.7  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  31.25 
 
 
129 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  56.52 
 
 
129 aa  53.9  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  31.31 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  34.83 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  28.69 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  42.68 
 
 
129 aa  52.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0008  ribonuclease P  32.99 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000255186 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  30.7 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5311  ribonuclease P  32.99 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0346243 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1424  ribonuclease P protein component  32.17 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18331  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14200  ribonuclease P protein component  29.36 
 
 
112 aa  52  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  31.82 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  30.91 
 
 
132 aa  51.6  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  41.89 
 
 
145 aa  51.6  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  36.84 
 
 
180 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  33.68 
 
 
122 aa  51.6  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0001  ribonuclease P  32.99 
 
 
134 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  31.82 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  32.29 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  29.17 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3966  ribonuclease P protein component  30.56 
 
 
122 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142048  normal  0.0834112 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1265  ribonuclease P protein component  28.43 
 
 
127 aa  50.8  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000149389  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  41.46 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3123  ribonuclease P protein component  31.78 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000870513  hitchhiker  0.0000000610775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5745  ribonuclease P  32.99 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936025  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  30.49 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2932  hypothetical protein  38.75 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  29.09 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3317  ribonuclease P  36.67 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4266  ribonuclease P  35.37 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000515429  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1368  ribonuclease P protein component  35.8 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.778952  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>