138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1040 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  100 
 
 
129 aa  255  1e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  59.83 
 
 
131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  63.54 
 
 
117 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  59 
 
 
117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  46.23 
 
 
118 aa  95.9  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1265  ribonuclease P protein component  33.61 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000149389  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  35.78 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  37.08 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  39.77 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  35.14 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  33.94 
 
 
109 aa  62.8  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  32.14 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  37.5 
 
 
115 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0970  ribonuclease P protein component  33.61 
 
 
132 aa  62  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  37.5 
 
 
115 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  36.61 
 
 
115 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  33.93 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  42.5 
 
 
109 aa  60.8  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  33.63 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  36.61 
 
 
115 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  37.5 
 
 
115 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  36.61 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  36.61 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  39.36 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  36.61 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2932  hypothetical protein  32.98 
 
 
114 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  36.61 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  36.61 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  41.46 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3076  hypothetical protein  31.91 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  35.87 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  36.61 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6370  ribonuclease P  35.87 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0001  ribonuclease P  37.63 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  35.71 
 
 
115 aa  57.4  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0008  ribonuclease P  37.63 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000255186 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  37.23 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5311  ribonuclease P  37.63 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0346243 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  31.25 
 
 
123 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  35.71 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  41.38 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  30.28 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  32.98 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  34.69 
 
 
126 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52470  ribonuclease P  32.61 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  33.33 
 
 
117 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4266  ribonuclease P  28.57 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000515429  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  26.27 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  39.08 
 
 
117 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  39.08 
 
 
117 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  43.28 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4037  ribonuclease P  28.57 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  27.59 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  31.19 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  28.57 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  31.18 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002014  ribonuclease P protein component  34.21 
 
 
107 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000192203  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  27.27 
 
 
107 aa  51.6  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  26.67 
 
 
116 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0134  ribonuclease P protein component  35.9 
 
 
115 aa  50.4  0.000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0423414  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  26.67 
 
 
116 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  30.23 
 
 
116 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  33.33 
 
 
116 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0201  ribonuclease P  38.46 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2760  ribonuclease P  33.33 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000461705  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  24.77 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2399  ribonuclease P protein component  30.23 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.71543  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  33.33 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  31.11 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2923  ribonuclease P  37.35 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000863254  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  27.45 
 
 
125 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  27.45 
 
 
125 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  36.05 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  30.95 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3615  ribonuclease P protein component  31.78 
 
 
385 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5614  ribonuclease P protein component  31.52 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5136  ribonuclease P  31.52 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5745  ribonuclease P  31.52 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936025  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  30.95 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  32 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2333  ribonuclease P protein component  29.79 
 
 
120 aa  47.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3777  ribonuclease P  27.1 
 
 
118 aa  47.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000556747  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  32.29 
 
 
116 aa  47.4  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  28.41 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3868  ribonuclease P  24.3 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000277263  unclonable  0.00000245558 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  26.72 
 
 
113 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3035  ribonuclease P protein component  25.77 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2602  ribonuclease P protein component  25.23 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.201057  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0006  ribonuclease P  26.88 
 
 
118 aa  45.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  25.27 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3897  ribonuclease P protein component  30.7 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590207  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  28.71 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  30 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2237  ribonuclease P protein component  31.43 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  26.88 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135  ribonuclease P  31.11 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000166605  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  33.75 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4382  ribonuclease P  26.88 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000348711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>