129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1542 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 162 aa  327  6e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  36 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  34.13 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  32.17 
 
 		 125 aa  60.5  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  32.17 
 
 		 125 aa  60.5  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  33.05 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  43.84 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  35.05 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  30.43 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3868  ribonuclease P  37.4 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000277263  unclonable  0.00000245558 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  41.43 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  40.22 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3155  ribonuclease P protein component  41.46 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0217012  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  30.77 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  30.77 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  46.03 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  32.99 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  46.03 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  38.38 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  38.38 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  31.9 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  31.03 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  43.04 
 
 		 130 aa  53.9  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  29.13 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  44.44 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  44.44 
 
 		 119 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  44.44 
 
 		 119 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  44.44 
 
 		 119 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  44.44 
 
 		 119 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  38.38 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  32.54 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  38.54 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  44.44 
 
 		 119 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1919  ribonuclease P protein component  46.38 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.100919  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  46.03 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1265  ribonuclease P protein component  32.98 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000149389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4004  ribonuclease P  33.85 
 
 		 118 aa  51.6  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119749  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  32.08 
 
 		 107 aa  51.6  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3942  ribonuclease P  33.85 
 
 		 118 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000139461  unclonable  0.0000000000208872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4034  ribonuclease P  33.85 
 
 		 118 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000319179  hitchhiker  0.000155322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0008  ribonuclease P  33.85 
 
 		 118 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000450646  unclonable  0.0000000000397397 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4327  ribonuclease P  34.62 
 
 		 118 aa  50.8  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000794478  unclonable  0.00000000000188803 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4382  ribonuclease P  34.62 
 
 		 118 aa  50.8  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000348711  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4381  ribonuclease P  34.62 
 
 		 118 aa  50.8  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000190839  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  38.04 
 
 		 116 aa  50.8  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4523  ribonuclease P  34.62 
 
 		 118 aa  50.8  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000021378  hitchhiker  0.000108776 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3777  ribonuclease P  35.38 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000556747  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0004  ribonuclease P  33.07 
 
 		 120 aa  50.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000936038  unclonable  0.0000000000697895 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0006  ribonuclease P  33.85 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3076  hypothetical protein  31.73 
 
 		 114 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  34.34 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3035  ribonuclease P protein component  36.7 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  34.34 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  34.31 
 
 		 136 aa  48.5  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  30.28 
 
 		 116 aa  48.5  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  31.18 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4931  ribonuclease P  34.38 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000059586  unclonable  0.00000000749508 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  54.55 
 
 		 180 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4259  ribonuclease P  34.88 
 
 		 120 aa  48.1  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000742435  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2932  hypothetical protein  31.43 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4065  ribonuclease P  33.08 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000140717  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2390  ribonuclease P protein component  31.93 
 
 		 130 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102633  hitchhiker  0.0000000753131 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  33.33 
 
 		 118 aa  47.8  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000676804  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  50.75 
 
 		 119 aa  47.4  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  62.79 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  41.27 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  62.79 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5052  ribonuclease P protein component  31.54 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107995  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2760  ribonuclease P  29.46 
 
 		 127 aa  46.6  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000461705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  41.67 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  40.23 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  36.84 
 
 		 114 aa  45.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  28.91 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  31.37 
 
 		 134 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  39.71 
 
 		 119 aa  45.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52470  ribonuclease P  43.42 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  41.67 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1829  ribonuclease P protein component  35 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  55.81 
 
 		 123 aa  44.7  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  34.57 
 
 		 109 aa  44.3  0.0007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002014  ribonuclease P protein component  34.74 
 
 		 107 aa  44.3  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000192203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  41.51 
 
 		 113 aa  44.3  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  35.78 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  32.69 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  28.93 
 
 		 121 aa  43.9  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  27.78 
 
 		 117 aa  43.9  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03587  ribonuclease P  34.78 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.201936  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4262  ribonuclease P protein component  34.44 
 
 		 108 aa  43.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117782  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4266  ribonuclease P  34.44 
 
 		 119 aa  43.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000515429  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3317  ribonuclease P  38 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6370  ribonuclease P  34.86 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4291  ribonuclease P  33.33 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4071  ribonuclease P  34.78 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00679811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4221  ribonuclease P  34.78 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4125  ribonuclease P  35.87 
 
 		 119 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00333224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4175  ribonuclease P  35.87 
 
 		 119 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.936833  normal  0.955569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4053  ribonuclease P  35.87 
 
 		 119 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000316737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4068  ribonuclease P  35.87 
 
 		 119 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000599062  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4232  ribonuclease P  35.87 
 
 		 119 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000722418  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>