150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2237 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2237  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 109 aa  220  4.9999999999999996e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  43.14 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  36.45 
 
 		 113 aa  87  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  38.61 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  41.67 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  38.14 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  36.73 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  32.65 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  36.73 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  36.73 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  36.73 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  36.73 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  39.39 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  36.73 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  36.73 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  35.71 
 
 		 115 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  35.71 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  29.9 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  37.37 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  35.19 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  35.19 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  37.78 
 
 		 126 aa  67  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  42.17 
 
 		 132 aa  66.6  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  42.35 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  31.48 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  33.67 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  36.14 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  38.75 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  34.62 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  33.67 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  40.45 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  35.79 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  32.63 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  32.63 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  32.63 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  28.85 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  30 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  38.46 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  42.86 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  30.69 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  44.59 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  43.42 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  38.38 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  31.43 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  36.26 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  28.57 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  45.59 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  31.96 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  56.14 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  38.46 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  42.67 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  42.67 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  30.67 
 
 		 110 aa  52.8  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2523  ribonuclease P protein component  45.45 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0265349  hitchhiker  0.0000065266 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  32.1 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1863  RNase P protein component  30.39 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.546361  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  39.71 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  37.36 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  38.37 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  37.35 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  49.18 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  45.71 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  42.05 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  51.67 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  32.41 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  44.71 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  34.78 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2602  ribonuclease P protein component  35.92 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.201057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  31.68 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  39.56 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  37.8 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  35.37 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  50 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  38.1 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  44.12 
 
 		 189 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  35.35 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  38.1 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  50 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  43.53 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  31.31 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  42.19 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  37.65 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  30.86 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  33.33 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  31.13 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  39.76 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  25.74 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  33.98 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  25.89 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  52.08 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4062  ribonuclease P  32.69 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  58.7 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  37.18 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  36.19 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  43.33 
 
 		 240 aa  47  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2883  ribonuclease P protein component  31.73 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0117467  normal  0.419637 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1265  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000149389  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>