137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0129 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  100 
 
 
117 aa  236  1e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  59.46 
 
 
111 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  57.55 
 
 
109 aa  120  6e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  50.93 
 
 
115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  50.93 
 
 
115 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  50.93 
 
 
115 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  49.07 
 
 
115 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  49.07 
 
 
115 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  49.07 
 
 
119 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  49.07 
 
 
119 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  49.07 
 
 
119 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  49.07 
 
 
119 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  49.07 
 
 
119 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  49.07 
 
 
121 aa  104  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  46.43 
 
 
115 aa  103  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  47.46 
 
 
122 aa  103  8e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  42.86 
 
 
117 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  49.52 
 
 
117 aa  102  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  42.86 
 
 
117 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  43.64 
 
 
115 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  50.53 
 
 
116 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  43.59 
 
 
116 aa  88.6  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1863  RNase P protein component  37.61 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.546361  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  39.81 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  33.88 
 
 
120 aa  68.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  36.36 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  35.34 
 
 
116 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0552  ribonuclease P protein component  35.85 
 
 
110 aa  67  0.00000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  36.78 
 
 
116 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  32.63 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  34.19 
 
 
132 aa  62  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  35.63 
 
 
116 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  28.7 
 
 
119 aa  62  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  31.9 
 
 
116 aa  61.6  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0983  ribonuclease P protein component  32.63 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.162194  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  33.96 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0821  ribonuclease P protein component  31.58 
 
 
108 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  33.96 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1040  ribonuclease P protein component  31.58 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0513155  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  34.86 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  38.89 
 
 
110 aa  58.2  0.00000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  31.43 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  36.63 
 
 
119 aa  58.2  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  33.01 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  30.93 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  30.39 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  30 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  30.43 
 
 
111 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  29.82 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  31.82 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2883  ribonuclease P protein component  29.41 
 
 
123 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0117467  normal  0.419637 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  29 
 
 
121 aa  55.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  32.04 
 
 
115 aa  55.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  38.82 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  31.07 
 
 
116 aa  55.1  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1829  ribonuclease P protein component  43.75 
 
 
80 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  38.82 
 
 
119 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  29.31 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  32.99 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  29.63 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  29.63 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  31.96 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  35 
 
 
131 aa  51.6  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  32.99 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  25.23 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  35.79 
 
 
110 aa  51.2  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  32.99 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  28.57 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  28.7 
 
 
120 aa  50.1  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002014  ribonuclease P protein component  34.52 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000192203  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  29.59 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  27.56 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  35.14 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  36.99 
 
 
227 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  38.16 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  33.77 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  31.19 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  31.19 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  30.93 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1621  hypothetical protein  40 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  33.71 
 
 
130 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  31.58 
 
 
117 aa  47.4  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  35.82 
 
 
125 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  38.46 
 
 
240 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0552  ribonuclease P protein component  39.66 
 
 
81 aa  47  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3320  ribonuclease P protein component  26.53 
 
 
120 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  35.79 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  35.53 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  32.38 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2523  ribonuclease P protein component  35.56 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0265349  hitchhiker  0.0000065266 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3897  ribonuclease P protein component  30.1 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590207  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5080  ribonuclease P protein component  39.39 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.479331 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03486  ribonuclease P protein component  42.11 
 
 
109 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4101  ribonuclease P  27.12 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  29.57 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  29.57 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  29.57 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13958  ribonuclease P  36.71 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2932  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  37.65 
 
 
132 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>