135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0641 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  100 
 
 
132 aa  266  5.9999999999999995e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  53.44 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  63.64 
 
 
137 aa  130  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  60 
 
 
137 aa  130  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  63.64 
 
 
137 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  63.16 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  68.75 
 
 
129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  51.43 
 
 
240 aa  98.6  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  47.66 
 
 
106 aa  94  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  44.74 
 
 
162 aa  88.6  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  41.38 
 
 
189 aa  81.3  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0356  ribonuclease P protein component  55.24 
 
 
116 aa  78.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274871  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  46.73 
 
 
148 aa  77  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  39.64 
 
 
121 aa  71.2  0.000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  42.45 
 
 
150 aa  70.1  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0439  hypothetical protein  37.84 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00442765  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0068  ribonuclease P protein component  44.34 
 
 
242 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190277  decreased coverage  0.00398675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7325  ribonuclease P protein component  48.11 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  34.82 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0584  hypothetical protein  39.64 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000877288  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  42.17 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1922  ribonuclease P protein component  48.57 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.239501  normal  0.549748 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  39.18 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  39.18 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  34.82 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3075  ribonuclease P protein  50.47 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194424  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0684  ribonuclease P protein component  46.23 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.820887  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5080  ribonuclease P protein component  37.04 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.479331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5376  ribonuclease P protein  36.04 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  38.1 
 
 
135 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0637  ribonuclease P protein component  44.34 
 
 
113 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  35.71 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0300  ribonuclease P protein component  52.44 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  43.48 
 
 
121 aa  57.4  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  30 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  38.1 
 
 
129 aa  56.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0818  ribonuclease P protein component  47.73 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3704  ribonuclease P protein component  46.23 
 
 
111 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  43.48 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  40 
 
 
109 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3337  ribonuclease P protein  43.86 
 
 
174 aa  53.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0375  ribonuclease P  43.27 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.174091  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  37.29 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  37.29 
 
 
116 aa  52.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  44.12 
 
 
114 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  32.89 
 
 
227 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  30.91 
 
 
115 aa  51.6  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  31.37 
 
 
109 aa  51.2  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  41.25 
 
 
93 aa  51.6  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  36.07 
 
 
116 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  55.1 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  42.25 
 
 
131 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  57.14 
 
 
126 aa  50.1  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  34.86 
 
 
123 aa  50.1  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  57.14 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  41.43 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1362  ribonuclease P  37.17 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  38.96 
 
 
120 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  33.9 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2139  ribonuclease P protein component  46.46 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  51.02 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  51.02 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  48.98 
 
 
119 aa  47.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  48.98 
 
 
119 aa  47.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  48.98 
 
 
119 aa  47.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  48.98 
 
 
119 aa  47.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  36.71 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  48.98 
 
 
119 aa  47.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  35.05 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  48.98 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  32.04 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  48.98 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  39.13 
 
 
115 aa  47.4  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  38.81 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  51.06 
 
 
115 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  40.58 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  35.09 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  42.86 
 
 
124 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  32.73 
 
 
118 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  39.13 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  32.73 
 
 
118 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  32.73 
 
 
118 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  38.75 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  71.43 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  46.43 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  42.65 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  42.65 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  50 
 
 
116 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  63.89 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  30.63 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  35.63 
 
 
124 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14200  ribonuclease P protein component  40.58 
 
 
112 aa  43.9  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  36.62 
 
 
123 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  49.09 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0857  ribonuclease P protein component  34.29 
 
 
113 aa  43.5  0.0009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  40 
 
 
159 aa  43.5  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  31.86 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  50.98 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  36 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  32.35 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>