18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0857 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0857  ribonuclease P protein component  100 
 
 
113 aa  225  1e-58  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  34.48 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  37.14 
 
 
91 aa  47  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 
125 aa  47  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  28.07 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  31.4 
 
 
240 aa  45.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  32.53 
 
 
189 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  35.82 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  37.35 
 
 
122 aa  43.9  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  34.29 
 
 
132 aa  43.5  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  51.02 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  34.85 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  34.85 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  36.76 
 
 
137 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  34.83 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  35.29 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  34.62 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  35.29 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>