91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_27030 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  100 
 
 
93 aa  182  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  62.32 
 
 
91 aa  84.7  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4512  ribonuclease P protein component  63.51 
 
 
120 aa  80.1  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  54.65 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7099  ribonuclease P protein  63.64 
 
 
81 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  58.67 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  58.67 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  58.67 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  60.61 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9055  ribonuclease P protein  54.55 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00175664  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6486  ribonuclease P protein  51.95 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00207284  normal  0.0833987 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  54.93 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  51.47 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  61.33 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  51.47 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4699  ribonuclease P protein component  56.52 
 
 
117 aa  63.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  52.24 
 
 
122 aa  61.2  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  52.05 
 
 
119 aa  60.8  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2557  ribonuclease P protein component  52 
 
 
91 aa  60.8  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000049885  normal  0.280398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  63.33 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39790  ribonuclease P protein component  68.12 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000138929  normal  0.561767 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3729  ribonuclease P protein component  59.09 
 
 
112 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  45.74 
 
 
132 aa  57.4  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  45.68 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  44.93 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  47.06 
 
 
125 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  43.08 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  33.33 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  34.21 
 
 
115 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  43.21 
 
 
124 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  41.25 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4592  ribonuclease P protein component  63.49 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000331999  decreased coverage  0.0000978361 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  35.62 
 
 
121 aa  50.4  0.000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  33.33 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  33.33 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  33.33 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  33.33 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  33.33 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  33.33 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  33.33 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  36.11 
 
 
121 aa  48.9  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5110  ribonuclease P protein component  68.25 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0820058  unclonable  0.0000000144984 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  35.96 
 
 
240 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  42.03 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  32.05 
 
 
115 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  32.05 
 
 
115 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  42.25 
 
 
120 aa  47.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  40.58 
 
 
137 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  40.58 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1539  ribonuclease P protein component  43.82 
 
 
98 aa  47  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000058475  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  38.89 
 
 
111 aa  47  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  35.53 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  41.43 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  41.43 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4547  ribonuclease P protein component  55 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00136145  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  36.11 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  41.79 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  31.43 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  38.67 
 
 
227 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  36.11 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13958  ribonuclease P  41.79 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  28.36 
 
 
119 aa  44.7  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  47.14 
 
 
129 aa  44.3  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  39.71 
 
 
130 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  30.16 
 
 
109 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  34.21 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  35.29 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  32.5 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  31.58 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  29.33 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  31.94 
 
 
113 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  40.58 
 
 
129 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  21.33 
 
 
109 aa  42  0.003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  33.33 
 
 
109 aa  41.6  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  46.03 
 
 
126 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0356  ribonuclease P protein component  44.87 
 
 
116 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274871  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  41.89 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  50 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  46.03 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  32.39 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1368  ribonuclease P protein component  35.14 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.778952  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  35.82 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0857  ribonuclease P protein component  34.62 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  35.82 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  34.72 
 
 
189 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  36.92 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  36.84 
 
 
132 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  40.58 
 
 
148 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  46.67 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  32.58 
 
 
106 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  32.65 
 
 
107 aa  40  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>