74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_38050 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 91 aa  178  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  61.04 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  50.56 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  62.32 
 
 		 93 aa  84.7  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  57.5 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9055  ribonuclease P protein  55.17 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00175664  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2557  ribonuclease P protein component  51.69 
 
 		 91 aa  80.1  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000049885  normal  0.280398 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3729  ribonuclease P protein component  59.46 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6486  ribonuclease P protein  55.56 
 
 		 89 aa  77.8  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00207284  normal  0.0833987 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  58.46 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7099  ribonuclease P protein  58.46 
 
 		 81 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  46.67 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  56.52 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  50 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  54.79 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4699  ribonuclease P protein component  51.22 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4512  ribonuclease P protein component  51.81 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  45.88 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  45.88 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  45.88 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  56.25 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  48 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  49.35 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39790  ribonuclease P protein component  59.26 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000138929  normal  0.561767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  46.84 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  41.76 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4592  ribonuclease P protein component  69.49 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000331999  decreased coverage  0.0000978361 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  46.67 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  46.48 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  45.76 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  39.53 
 
 		 240 aa  50.8  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  36.49 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  36.49 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  36.49 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  36.49 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  36.49 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  36.49 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  36.92 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13958  ribonuclease P  38.57 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5110  ribonuclease P protein component  69.49 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0820058  unclonable  0.0000000144984 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  36.49 
 
 		 115 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4547  ribonuclease P protein component  49.38 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00136145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0857  ribonuclease P protein component  37.14 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  35.62 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  35.62 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  36.99 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  38.46 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  36.36 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7340  ribonuclease P protein component  45.57 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  36.62 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  45.21 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  35.21 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  42.47 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  35.82 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  39.71 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4863  ribonuclease P protein component  39.39 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  31.94 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  35.82 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  35.21 
 
 		 145 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4242  ribonuclease P protein component  51.52 
 
 		 142 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0023987  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  35 
 
 		 110 aa  42  0.003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0439  hypothetical protein  65.71 
 
 		 119 aa  42  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00442765  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  56.76 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  35.29 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  30.99 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  72 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  72 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  29.41 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0584  hypothetical protein  76 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000877288  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  47.83 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  33.73 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  37.68 
 
 		 116 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  37.68 
 
 		 116 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>