183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_23600 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  100 
 
 
121 aa  238  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  46.73 
 
 
116 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  49.52 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  44.79 
 
 
109 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  40.19 
 
 
115 aa  90.5  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  51.04 
 
 
113 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  44 
 
 
115 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  44 
 
 
119 aa  84  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  44 
 
 
115 aa  84  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  44 
 
 
119 aa  84  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  44 
 
 
119 aa  84  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  44 
 
 
119 aa  84  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  44 
 
 
119 aa  84  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  42.86 
 
 
126 aa  82  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  43 
 
 
115 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  44.23 
 
 
115 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  43 
 
 
115 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  42.31 
 
 
115 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  41.51 
 
 
116 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  34.95 
 
 
119 aa  78.2  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  43.52 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  43.52 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  37 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  33.98 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  35 
 
 
120 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  36.54 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  36.97 
 
 
131 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  33.33 
 
 
117 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  33.33 
 
 
117 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  32.08 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  37.93 
 
 
121 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  33.98 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  39.8 
 
 
116 aa  69.3  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  39.39 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  35.85 
 
 
116 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  38 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  36 
 
 
110 aa  67  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  30.48 
 
 
114 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 
123 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 
118 aa  63.9  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  32.38 
 
 
132 aa  63.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2237  ribonuclease P protein component  41.67 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  34.26 
 
 
119 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1256  ribonuclease P protein component  36 
 
 
115 aa  60.8  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000286956  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf882  ribonuclease P protein component  32.69 
 
 
112 aa  60.8  0.000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  30 
 
 
116 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  35.35 
 
 
117 aa  60.5  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  39.36 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  34.31 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  34.74 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  30.84 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  43.48 
 
 
132 aa  57.4  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  29 
 
 
121 aa  57  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  28.85 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  44.26 
 
 
145 aa  55.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  29 
 
 
117 aa  55.5  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  30.39 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3966  ribonuclease P protein component  38 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142048  normal  0.0834112 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1863  RNase P protein component  40.74 
 
 
122 aa  55.1  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.546361  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  36.45 
 
 
119 aa  54.3  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1424  ribonuclease P protein component  38.78 
 
 
122 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18331  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  50.98 
 
 
129 aa  53.9  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  30.85 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  30.85 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  32.26 
 
 
130 aa  53.9  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  31.07 
 
 
116 aa  53.5  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  32.69 
 
 
109 aa  53.5  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  36.14 
 
 
240 aa  52.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  28.43 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  36.99 
 
 
227 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0356  ribonuclease P protein component  38.1 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274871  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3123  ribonuclease P protein component  29.29 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000870513  hitchhiker  0.0000000610775 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  24.74 
 
 
135 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1195  ribonuclease P protein component  38.83 
 
 
135 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000104376  decreased coverage  0.00023065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  29.91 
 
 
129 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1265  ribonuclease P protein component  29.7 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000149389  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  33 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5376  ribonuclease P protein  30 
 
 
141 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827192  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  31.78 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  33 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  30.1 
 
 
154 aa  50.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  31.68 
 
 
137 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52470  ribonuclease P  32.29 
 
 
130 aa  50.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  31.65 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  36.11 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  34.92 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  30.1 
 
 
109 aa  49.7  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  28.89 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  43.86 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  39.68 
 
 
189 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  34.92 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4931  ribonuclease P  31.31 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000059586  unclonable  0.00000000749508 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  32.35 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  32.04 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  32.04 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  32.04 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  39.68 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  30.61 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1368  ribonuclease P protein component  29.17 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.778952  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>