94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5788 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  100 
 
 
118 aa  230  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  100 
 
 
118 aa  230  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  100 
 
 
118 aa  230  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  59.32 
 
 
119 aa  127  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  60.36 
 
 
124 aa  124  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13958  ribonuclease P  50.91 
 
 
125 aa  103  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  48.31 
 
 
127 aa  90.5  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  46.55 
 
 
122 aa  90.1  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  46.3 
 
 
136 aa  84.3  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  51.4 
 
 
130 aa  84.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9055  ribonuclease P protein  50 
 
 
109 aa  83.6  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00175664  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  44.55 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  48.6 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  47.22 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  40.16 
 
 
125 aa  80.5  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  48.6 
 
 
119 aa  79.7  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4512  ribonuclease P protein component  45.45 
 
 
120 aa  77  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  58.67 
 
 
93 aa  76.6  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7099  ribonuclease P protein  60.61 
 
 
81 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  32.11 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  32.11 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  32.11 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  32.11 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  32.11 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  32.11 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  32.11 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  33.33 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  41.13 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4863  ribonuclease P protein component  38.64 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  45.88 
 
 
91 aa  68.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3729  ribonuclease P protein component  45.37 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  32.43 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  29.36 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  29.36 
 
 
115 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  30.63 
 
 
121 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2557  ribonuclease P protein component  48 
 
 
91 aa  61.6  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000049885  normal  0.280398 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6486  ribonuclease P protein  42.5 
 
 
89 aa  60.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00207284  normal  0.0833987 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4242  ribonuclease P protein component  36.76 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0023987  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39790  ribonuclease P protein component  50.45 
 
 
122 aa  57  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000138929  normal  0.561767 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  35 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  27.03 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  39.67 
 
 
132 aa  53.5  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2160  ribonuclease P protein component  41.86 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4547  ribonuclease P protein component  52.13 
 
 
104 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00136145  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  34.62 
 
 
240 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  35.92 
 
 
114 aa  51.2  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  30.33 
 
 
159 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  29.6 
 
 
131 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7340  ribonuclease P protein component  42.5 
 
 
121 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  31.25 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  32.67 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4699  ribonuclease P protein component  40.22 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  27.35 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  32.04 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  32.14 
 
 
120 aa  47  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  35.94 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4062  ribonuclease P  26.32 
 
 
127 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  32.73 
 
 
132 aa  45.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  35.94 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  32.71 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  44.62 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  43.33 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  29.57 
 
 
117 aa  44.7  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  25.49 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0685  ribonuclease P protein component  26.72 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4101  ribonuclease P  27.19 
 
 
127 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  36.14 
 
 
116 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  27.52 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  32.71 
 
 
145 aa  44.7  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  36.84 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  37 
 
 
162 aa  43.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  32.84 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  31.62 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  32.93 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  39.29 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1539  ribonuclease P protein component  45.45 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000058475  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  38.89 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  32.11 
 
 
123 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  25.23 
 
 
117 aa  41.6  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  26.58 
 
 
107 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  25.23 
 
 
117 aa  41.6  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  38.1 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1829  ribonuclease P protein component  31.88 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  24.32 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  33.33 
 
 
121 aa  41.2  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  38.2 
 
 
137 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  33.98 
 
 
106 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  40.96 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  45.76 
 
 
132 aa  41.2  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  29.63 
 
 
116 aa  40.4  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  34.25 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  36.36 
 
 
129 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  39.77 
 
 
137 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  40.51 
 
 
133 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.284943 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>