172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1738 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 116 aa  230  5e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  40.35 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  40.35 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  39.47 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  37.74 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  44.3 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  35.85 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  32.65 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  38.94 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  41.23 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  39.8 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  44 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  38.89 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  41.23 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  41.23 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  41.23 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  41.23 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  41.23 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  41.23 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  40.35 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  40.35 
 
 		 115 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  33.02 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  34.82 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  32.73 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  35.14 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  38.89 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  36.7 
 
 		 115 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  39.25 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0001  ribonuclease P  41.56 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  27.83 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  37 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  33.33 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  36.73 
 
 		 116 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  35.64 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  34.69 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0008  ribonuclease P  40.26 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255186 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  31.63 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  31.48 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5311  ribonuclease P  40.26 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346243 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  34.74 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1863  RNase P protein component  36.61 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.546361  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  35.19 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2883  ribonuclease P protein component  31.37 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0117467  normal  0.419637 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  41.67 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  34.86 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4151  ribonuclease P protein component  34.09 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6370  ribonuclease P  41.67 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  27.27 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4291  ribonuclease P  33.71 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  35.35 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  32.08 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  40.28 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  27.27 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03587  ribonuclease P  32.58 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.201936  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4262  ribonuclease P protein component  32.58 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117782  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4125  ribonuclease P  32.95 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00333224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5745  ribonuclease P  40.26 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936025  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4175  ribonuclease P  32.95 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.936833  normal  0.955569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4053  ribonuclease P  32.95 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000316737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4232  ribonuclease P  32.95 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000722418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4071  ribonuclease P  32.58 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00679811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03531  hypothetical protein  32.58 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.118507  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4221  ribonuclease P  32.58 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4068  ribonuclease P  32.95 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000599062  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3917  ribonuclease P  32.58 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4214  ribonuclease P  32.58 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4266  ribonuclease P  32.95 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000515429  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  35.2 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  31.07 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  35.71 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4259  ribonuclease P  32.63 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000742435  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  33.71 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  30.93 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0030  ribonuclease P  32.95 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00687472  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  32.1 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  32.32 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4248  ribonuclease P  32.95 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000157593  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4155  ribonuclease P  32.95 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.58759e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3035  ribonuclease P protein component  32.98 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4037  ribonuclease P  31.31 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  33.06 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5136  ribonuclease P  33.33 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5134  ribonuclease P  31.46 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130238  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  27.1 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5614  ribonuclease P protein component  38.96 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1256  ribonuclease P protein component  32.29 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000286956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52470  ribonuclease P  33.66 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  35.16 
 
 		 240 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4314  ribonuclease P protein component  37.37 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  30.21 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000676804  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0006  ribonuclease P  30.21 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3777  ribonuclease P  31.25 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000556747  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  30.56 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  31.73 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2932  hypothetical protein  39.19 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  37.8 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>