174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00437 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  100 
 
 		 118 aa  243  8e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002014  ribonuclease P protein component  96.26 
 
 		 107 aa  214  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000192203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  86.44 
 
 		 118 aa  208  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  82.61 
 
 		 117 aa  199  9e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  56.78 
 
 		 118 aa  143  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4232  ribonuclease P  56.78 
 
 		 119 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000722418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4068  ribonuclease P  56.78 
 
 		 119 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000599062  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4125  ribonuclease P  56.78 
 
 		 119 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00333224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4053  ribonuclease P  56.78 
 
 		 119 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000316737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4175  ribonuclease P  56.78 
 
 		 119 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.936833  normal  0.955569 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4266  ribonuclease P  57.89 
 
 		 119 aa  133  9e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000515429  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03587  ribonuclease P  55.93 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.201936  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4071  ribonuclease P  55.93 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00679811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4037  ribonuclease P  57.66 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4221  ribonuclease P  55.93 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03531  hypothetical protein  55.93 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.118507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3917  ribonuclease P  55.93 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4214  ribonuclease P  55.93 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0030  ribonuclease P  57.89 
 
 		 119 aa  131  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00687472  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4155  ribonuclease P  57.02 
 
 		 119 aa  130  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.58759e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5134  ribonuclease P  55.08 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130238  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  55.26 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000676804  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135  ribonuclease P  54.95 
 
 		 119 aa  124  6e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000166605  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4151  ribonuclease P protein component  55.14 
 
 		 108 aa  123  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4314  ribonuclease P protein component  51.75 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4262  ribonuclease P protein component  54.21 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117782  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4291  ribonuclease P  53.27 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4248  ribonuclease P  55.34 
 
 		 108 aa  118  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000157593  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0006  ribonuclease P  47.46 
 
 		 118 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4004  ribonuclease P  46.61 
 
 		 118 aa  114  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119749  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3942  ribonuclease P  46.61 
 
 		 118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000139461  unclonable  0.0000000000208872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4034  ribonuclease P  46.61 
 
 		 118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000319179  hitchhiker  0.000155322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0008  ribonuclease P  46.61 
 
 		 118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000450646  unclonable  0.0000000000397397 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3777  ribonuclease P  47.46 
 
 		 118 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000556747  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4065  ribonuclease P  46.61 
 
 		 118 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000140717  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4523  ribonuclease P  45.76 
 
 		 118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000021378  hitchhiker  0.000108776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4382  ribonuclease P  45.76 
 
 		 118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000348711  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4381  ribonuclease P  45.76 
 
 		 118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000190839  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4327  ribonuclease P  45.76 
 
 		 118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000794478  unclonable  0.00000000000188803 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  50.83 
 
 		 134 aa  110  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4259  ribonuclease P  45.76 
 
 		 120 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000742435  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3868  ribonuclease P  44.92 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000277263  unclonable  0.00000245558 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5614  ribonuclease P protein component  49.09 
 
 		 133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5136  ribonuclease P  49.09 
 
 		 133 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52470  ribonuclease P  47.83 
 
 		 130 aa  107  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0001  ribonuclease P  47.83 
 
 		 134 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4931  ribonuclease P  44.83 
 
 		 119 aa  107  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000059586  unclonable  0.00000000749508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0008  ribonuclease P  47.83 
 
 		 134 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5745  ribonuclease P  49.09 
 
 		 133 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936025  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5311  ribonuclease P  47.83 
 
 		 134 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346243 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0004  ribonuclease P  44.07 
 
 		 120 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000936038  unclonable  0.0000000000697895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  48.7 
 
 		 135 aa  103  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5052  ribonuclease P protein component  45.08 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107995  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3035  ribonuclease P protein component  45.22 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6370  ribonuclease P  47.83 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0134  ribonuclease P protein component  45.87 
 
 		 115 aa  101  3e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0423414  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  44.95 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  38.53 
 
 		 119 aa  94  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2883  ribonuclease P protein component  42.59 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0117467  normal  0.419637 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4016  ribonuclease P protein component  43.24 
 
 		 135 aa  90.1  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0116419  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3317  ribonuclease P  39.83 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3320  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1229  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0151351  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4486  ribonuclease P protein component  39.32 
 
 		 132 aa  83.6  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000175876  hitchhiker  0.00000000129187 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2390  ribonuclease P protein component  42.16 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102633  hitchhiker  0.0000000753131 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2146  ribonuclease P protein component  38.18 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164935  unclonable  0.0000011472 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3897  ribonuclease P protein component  37.82 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590207  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2413  ribonuclease P protein component  33.64 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0343106  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0001  ribonuclease P protein component  41.24 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0001269  unclonable  0.0000473513 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3076  hypothetical protein  37.27 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2932  hypothetical protein  37.27 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2760  ribonuclease P  42.86 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000461705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2602  ribonuclease P protein component  34.86 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.201057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  38.18 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  37.74 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  37.74 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04102  ribonuclease P  56 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000363404  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  36.27 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0203  ribonuclease P protein component  31.62 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  33.68 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2120  ribonuclease P protein component  30.97 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  39.6 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  36.52 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  34.12 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  34.12 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3462  ribonuclease P protein component  36.78 
 
 		 166 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0165621  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2826  ribonuclease P protein component  47.62 
 
 		 99 aa  57  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  32.61 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2225  ribonuclease P  36.27 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  34.62 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  34.95 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  35.71 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  36.17 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  34.62 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  34.62 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  34.62 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  34.62 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  34.62 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03486  ribonuclease P protein component  37.68 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  32.14 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>