179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0121 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  100 
 
 
119 aa  231  3e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  35.78 
 
 
115 aa  72  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  32.74 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  31.9 
 
 
120 aa  70.5  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  37.04 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  45.05 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  35.14 
 
 
131 aa  67  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  41.05 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  43.53 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  38.53 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  38.53 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  34.23 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  37.61 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  37.04 
 
 
116 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 
180 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  35.4 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  37.27 
 
 
109 aa  63.5  0.0000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  37.04 
 
 
116 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  34.29 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  32.14 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  35.24 
 
 
115 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  35.96 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  35.11 
 
 
116 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  36.28 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  36.28 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  37.78 
 
 
116 aa  62  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3460  ribonuclease P protein component  35.59 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  34.04 
 
 
116 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1265  ribonuclease P protein component  33.05 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000149389  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 
118 aa  60.5  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3759  ribonuclease P protein component  34.17 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  34.48 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  36.63 
 
 
117 aa  58.2  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  30.97 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  34.82 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  33.04 
 
 
115 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  33.04 
 
 
115 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  39.56 
 
 
123 aa  57.4  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  33.62 
 
 
115 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  33.04 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  33.62 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  33.62 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  33.62 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  33.62 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  38.37 
 
 
130 aa  56.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3320  ribonuclease P protein component  27.27 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  33.62 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  34.38 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3100  ribonuclease P protein component  41.67 
 
 
169 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000456921 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  33.06 
 
 
129 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  33.93 
 
 
118 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  30.77 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  36.45 
 
 
121 aa  54.3  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  32.14 
 
 
115 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  33.33 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  33.02 
 
 
116 aa  53.9  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  34.55 
 
 
116 aa  53.9  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  29.77 
 
 
159 aa  53.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  33.33 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3155  ribonuclease P protein component  33.78 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0217012  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  34.88 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  31 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6522  ribonuclease P protein  40.28 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3156  ribonuclease P protein component  40.28 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000128302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3217  ribonuclease P protein component  40.28 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  31.25 
 
 
154 aa  51.6  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  26.32 
 
 
119 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4486  ribonuclease P protein component  30.17 
 
 
132 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000175876  hitchhiker  0.00000000129187 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  31.73 
 
 
116 aa  51.2  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3237  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 
155 aa  50.8  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.254569  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  35.48 
 
 
117 aa  51.2  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3615  ribonuclease P protein component  38.57 
 
 
385 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2551  ribonuclease P protein component  38.89 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  34.88 
 
 
132 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3165  ribonuclease P protein component  38.89 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46639  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3988  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 
161 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0302  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 
155 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4065  ribonuclease P  32.17 
 
 
118 aa  50.4  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000140717  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3399  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 
136 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  27.93 
 
 
116 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4464  ribonuclease P  37.5 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0853749 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  30.25 
 
 
119 aa  50.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  27.93 
 
 
116 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2846  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 
136 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.752825  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2239  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 
136 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0091  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 
136 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0105  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 
136 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3552  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 
136 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  29 
 
 
109 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0167  ribonuclease P  33.93 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00183081  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3183  ribonuclease P protein component  38.89 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.204926 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0004  ribonuclease P  33.93 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000936038  unclonable  0.0000000000697895 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  28.3 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4314  ribonuclease P protein component  33.91 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4155  ribonuclease P  33.03 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.58759e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5052  ribonuclease P protein component  34.38 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107995  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  30.43 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000676804  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1919  ribonuclease P protein component  42.22 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.100919  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4037  ribonuclease P  33.03 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4931  ribonuclease P  33.93 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000059586  unclonable  0.00000000749508 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>