125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3328 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 113 aa  232  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  44.95 
 
 		 109 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  51.04 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  43.64 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  43.64 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  35.4 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  43.56 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  37.14 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  38.38 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2237  ribonuclease P protein component  36.45 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  35.24 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  37.61 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  35.24 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  35.24 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  35.24 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  35.24 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  35.24 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  36.19 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  35.24 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  35.24 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  35.24 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  37.72 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  36.19 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  36.19 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  34.29 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  36.54 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  37.38 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  39.56 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  38.89 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  35.85 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  31.68 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  31.37 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  34.29 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  39.29 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  33.65 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2523  ribonuclease P protein component  45.12 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0265349  hitchhiker  0.0000065266 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  40.96 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  31 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  34.02 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  34.86 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  33.96 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  32.48 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  30.48 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  33.65 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  27.45 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  33.96 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  29.91 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  39.34 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  34.41 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  35.82 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  35 
 
 		 126 aa  52  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  39.34 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  22.81 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  35.71 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  32.14 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  29.73 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2883  ribonuclease P protein component  29.13 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0117467  normal  0.419637 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  34.15 
 
 		 227 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  33.73 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0983  ribonuclease P protein component  30.48 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.162194  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0821  ribonuclease P protein component  29.52 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0004  ribonuclease P  27.62 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000936038  unclonable  0.0000000000697895 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4931  ribonuclease P  27.62 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000059586  unclonable  0.00000000749508 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1265  ribonuclease P protein component  27.84 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000149389  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1040  ribonuclease P protein component  29.52 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0513155  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4065  ribonuclease P  25.71 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000140717  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3868  ribonuclease P  26.67 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000277263  unclonable  0.00000245558 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  29.79 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1256  ribonuclease P protein component  31.46 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000286956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  32.04 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  25.69 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  32.86 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1919  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.100919  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4259  ribonuclease P  26.73 
 
 		 120 aa  47.4  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000742435  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  38.18 
 
 		 189 aa  47  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  30.51 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  28.57 
 
 		 118 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000676804  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  42.62 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  27.54 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  31.09 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  37.7 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  31.43 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  34.72 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  36.67 
 
 		 240 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1863  RNase P protein component  32.77 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.546361  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  25.74 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  31.18 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  28.57 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  23.48 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  29.66 
 
 		 159 aa  44.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0006  ribonuclease P  23.76 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  36.07 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3777  ribonuclease P  24.76 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000556747  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3942  ribonuclease P  23.76 
 
 		 118 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000139461  unclonable  0.0000000000208872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4034  ribonuclease P  23.76 
 
 		 118 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000319179  hitchhiker  0.000155322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0008  ribonuclease P  23.76 
 
 		 118 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000450646  unclonable  0.0000000000397397 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4004  ribonuclease P  24.75 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>