97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2996 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  100 
 
 		 125 aa  245  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  100 
 
 		 125 aa  245  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  45.3 
 
 		 126 aa  90.9  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  44.55 
 
 		 116 aa  89.4  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  44.54 
 
 		 116 aa  88.6  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  42.48 
 
 		 115 aa  87  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  43.64 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  43.52 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  38.46 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  35.14 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  35.14 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  35.14 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  35.14 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  35.14 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  35.14 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  35.14 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  34.17 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  33.33 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  34.23 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  34.23 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  39.09 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  33.33 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  30.58 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  37.39 
 
 		 120 aa  66.6  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  33.65 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  35.14 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  36.21 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  37.96 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  36.28 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  32.17 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  32.76 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  32.76 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  31.36 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  34.55 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  32.52 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  32.14 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  30.09 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1265  ribonuclease P protein component  30.48 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000149389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  30.4 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  34.83 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  35.71 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  31.82 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  33.94 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  31.71 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2237  ribonuclease P protein component  35.19 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1424  ribonuclease P protein component  32.43 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  30.17 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1863  RNase P protein component  31.82 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.546361  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  31.58 
 
 		 116 aa  52  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  33.7 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3966  ribonuclease P protein component  29.73 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142048  normal  0.0834112 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  39.39 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  38.2 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3155  ribonuclease P protein component  36.76 
 
 		 87 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0217012  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4101  ribonuclease P  32.73 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0552  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  42.42 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  29.73 
 
 		 116 aa  48.1  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  27.45 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  31.19 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  36.96 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  37.08 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  31.82 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  27.36 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  29.63 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  27.62 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  28.83 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  30.25 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  30.95 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  34.88 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  30.25 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0356  ribonuclease P protein component  32.17 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274871  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  28.97 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  26.47 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  32.46 
 
 		 240 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4062  ribonuclease P  30.91 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  36 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  36.14 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  30.84 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0983  ribonuclease P protein component  31.73 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.162194  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  25.69 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1040  ribonuclease P protein component  30.77 
 
 		 108 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0513155  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0821  ribonuclease P protein component  30.77 
 
 		 108 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1829  ribonuclease P protein component  36.23 
 
 		 80 aa  42  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  41.82 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4931  ribonuclease P  26.72 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000059586  unclonable  0.00000000749508 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  35.82 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4266  ribonuclease P  34.33 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000515429  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  29.46 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  29.91 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0030  ribonuclease P  34.33 
 
 		 119 aa  40.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00687472  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  30.3 
 
 		 116 aa  40  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  30.3 
 
 		 116 aa  40  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0201  ribonuclease P  34.48 
 
 		 137 aa  40  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>