165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2576 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  100 
 
 
119 aa  235  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  36.52 
 
 
120 aa  82  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  37.96 
 
 
111 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  34.95 
 
 
121 aa  78.2  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  34.55 
 
 
115 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  34.55 
 
 
115 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  34.55 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  34.55 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  34.55 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  34.55 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  34.55 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  35.09 
 
 
116 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  32.11 
 
 
109 aa  73.9  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  34.55 
 
 
115 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  34.55 
 
 
115 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  38.54 
 
 
109 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  42.11 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  32.73 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  33.64 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  31.07 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  35.05 
 
 
107 aa  67  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  28.18 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  33.93 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  31.19 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0552  ribonuclease P protein component  32.71 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  28.18 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  33.96 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  30.1 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  28.7 
 
 
117 aa  62  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  37.04 
 
 
116 aa  61.2  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  31 
 
 
113 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  29.35 
 
 
131 aa  60.5  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1256  ribonuclease P protein component  29.67 
 
 
115 aa  58.5  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000286956  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  32.69 
 
 
122 aa  57.4  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6370  ribonuclease P  30.84 
 
 
135 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  26.17 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  31.03 
 
 
130 aa  57  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  30.84 
 
 
135 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0008  ribonuclease P  33.96 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000255186 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  29.9 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  30.53 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5311  ribonuclease P  33.96 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0346243 
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  33.63 
 
 
120 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3123  ribonuclease P protein component  32.38 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000870513  hitchhiker  0.0000000610775 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  33.63 
 
 
126 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  34.88 
 
 
132 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  26.27 
 
 
122 aa  55.1  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0001  ribonuclease P  33.02 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  31.82 
 
 
125 aa  55.1  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  31.82 
 
 
125 aa  55.1  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5614  ribonuclease P protein component  34.83 
 
 
133 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5136  ribonuclease P  34.83 
 
 
133 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  37.08 
 
 
134 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  27.68 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  27.68 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  31.15 
 
 
132 aa  54.3  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  27.03 
 
 
118 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  27.03 
 
 
118 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  27.03 
 
 
118 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  30.39 
 
 
119 aa  53.5  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  28.44 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  37.68 
 
 
116 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  37.68 
 
 
116 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5745  ribonuclease P  34.83 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936025  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2760  ribonuclease P  31.78 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000461705  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  33 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  24.56 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  32.38 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  30.77 
 
 
117 aa  52  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  26.32 
 
 
119 aa  52  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  29.57 
 
 
129 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  35.42 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  34.67 
 
 
135 aa  51.6  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  34.62 
 
 
110 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  31.25 
 
 
136 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  24.17 
 
 
119 aa  52  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 
116 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  31.4 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  28.97 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  32.71 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  44.12 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52470  ribonuclease P  33.33 
 
 
130 aa  50.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  33.8 
 
 
124 aa  50.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  30.59 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  24.53 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0552  ribonuclease P protein component  36.59 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  25.78 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  30.97 
 
 
126 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  31.31 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135  ribonuclease P  29.82 
 
 
119 aa  48.9  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000166605  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  33.67 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  33.33 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1040  ribonuclease P protein component  29.52 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0513155  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  31.82 
 
 
125 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  28 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  36.26 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0821  ribonuclease P protein component  29.52 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2237  ribonuclease P protein component  38.75 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  33.7 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>