156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2141 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 130 aa  264  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  48.74 
 
 		 130 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  54.13 
 
 		 180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  50.94 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1919  ribonuclease P protein component  53.57 
 
 		 92 aa  87  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.100919  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  37.82 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  36.13 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3155  ribonuclease P protein component  47.5 
 
 		 87 aa  71.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0217012  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  39.76 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  41.05 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  33.05 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  37.96 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  37.72 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  36.28 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  34.62 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  34.62 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  37.74 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  33.06 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  33.02 
 
 		 115 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  39.6 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  37.04 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  33.02 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  30.84 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  35.14 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  37.96 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2413  ribonuclease P protein component  40.62 
 
 		 123 aa  57  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0343106  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  35.71 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  33.02 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  31.13 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  31.13 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  31.13 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  31.13 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  31.13 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  40.45 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  37.65 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  31.13 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  31.13 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  37.04 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  37.04 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  39.33 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  39.33 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  33.94 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  33.94 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  40.66 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  32.08 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  34.82 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  43.04 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  31.73 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  42.05 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  26.05 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  29.41 
 
 		 121 aa  52  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  33.03 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5745  ribonuclease P  38.14 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936025  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  33.65 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  33.73 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0167  ribonuclease P  34.19 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00183081  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  33.96 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5376  ribonuclease P protein  30.43 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827192  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  39.33 
 
 		 116 aa  50.1  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  39.33 
 
 		 116 aa  50.1  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  40.21 
 
 		 129 aa  50.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5614  ribonuclease P protein component  38.54 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  40.24 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0001  ribonuclease P  41.67 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3320  ribonuclease P protein component  38.46 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5080  ribonuclease P protein component  34.91 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.479331 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  26.61 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0375  ribonuclease P  39.66 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.174091  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52470  ribonuclease P  46.58 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  28.81 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4155  ribonuclease P  34.48 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.58759e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5136  ribonuclease P  38.82 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  34.07 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4486  ribonuclease P protein component  38.14 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000175876  hitchhiker  0.00000000129187 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  36.05 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2883  ribonuclease P protein component  40.43 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0117467  normal  0.419637 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  34.44 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  36.17 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  40.48 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4037  ribonuclease P  35.29 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  40 
 
 		 118 aa  47.4  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  34.21 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4314  ribonuclease P protein component  40.96 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  33.71 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  43.84 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0030  ribonuclease P  36.21 
 
 		 119 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00687472  normal  0.199191 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03587  ribonuclease P  35.34 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.201936  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  38.1 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0008  ribonuclease P  40.48 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255186 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03531  hypothetical protein  35.34 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.118507  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  37.84 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  37.36 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  36.11 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5311  ribonuclease P  40.48 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6370  ribonuclease P  39.29 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4508  ribonuclease P protein component  39.47 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  34.15 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3917  ribonuclease P  35.34 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4214  ribonuclease P  35.34 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4071  ribonuclease P  35.34 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00679811  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>