69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5376 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5376  ribonuclease P protein  100 
 
 		 141 aa  270  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827192  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5080  ribonuclease P protein component  75.89 
 
 		 138 aa  200  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.479331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3504  ribonuclease P protein component  59.5 
 
 		 206 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2309  ribonuclease P protein component  58.46 
 
 		 169 aa  107  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  0.100774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2631  ribonuclease P protein component  61.86 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88975  normal  0.0705179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2352  ribonuclease P protein component  61.02 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.125747 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  36.97 
 
 		 227 aa  70.9  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  38.41 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  40.94 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  45.54 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  41.03 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  39.69 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  40.57 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  40.57 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  33.04 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  39.62 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  34.35 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  36.04 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  38.68 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  34.82 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3075  ribonuclease P protein  43.97 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7325  ribonuclease P protein component  41.46 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  31.54 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0068  ribonuclease P protein component  40.71 
 
 		 242 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190277  decreased coverage  0.00398675 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3704  ribonuclease P protein component  41.38 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0684  ribonuclease P protein component  44.07 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.820887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0375  ribonuclease P  42.86 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.174091  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0637  ribonuclease P protein component  43.59 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150092  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1922  ribonuclease P protein component  40.77 
 
 		 187 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.239501  normal  0.549748 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  30 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  30.43 
 
 		 130 aa  50.4  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3337  ribonuclease P protein  40.68 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  38.64 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  33.64 
 
 		 240 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  33.59 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  33.08 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  32.04 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  35.62 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  32.73 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 180 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  25.23 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  26.32 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  31.53 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0818  ribonuclease P protein component  45.88 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  34.25 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  32.97 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  37.88 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  24.11 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  25.26 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  25.77 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  31.43 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  25.26 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  26.88 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  25.26 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  25.26 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  25.26 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  25.26 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 120 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  32.29 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  33.03 
 
 		 114 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  47.46 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  30.93 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  36.99 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  24.32 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1362  ribonuclease P  34.82 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  31.25 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0439  hypothetical protein  26.53 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00442765  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  36.96 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 126 aa  40  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>