195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3215 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 114 aa  221  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  47.75 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  33.94 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  33.03 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  32.65 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  33.64 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  33.64 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  33.64 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  33.64 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  33.64 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  33.64 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  40.38 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  33.64 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  40.38 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  34.58 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  32.73 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  30.48 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  32.73 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  33.98 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  32.69 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  37.25 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  36.46 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  35 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  33.33 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  30.48 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  28.04 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  32.99 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  32.99 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  31.78 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  43.01 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1256  ribonuclease P protein component  35.19 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000286956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  29.17 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  38.46 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  37.04 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  39.36 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  30.09 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  30.09 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  40.86 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  33.67 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  26.17 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  47.69 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  38.6 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2883  ribonuclease P protein component  41.12 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0117467  normal  0.419637 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  40.74 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  44.93 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  31.82 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  36.26 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  30.48 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  32.41 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  44 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3035  ribonuclease P protein component  38.54 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  30.93 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1863  RNase P protein component  30.63 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.546361  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  31.43 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  41 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  33.33 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  40.54 
 
 		 136 aa  52.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  40 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  40.91 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  43.55 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  47.06 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4512  ribonuclease P protein component  37.38 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  28.07 
 
 		 162 aa  51.6  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  25.51 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  44.12 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  45.45 
 
 		 240 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  39.73 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  43.48 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002014  ribonuclease P protein component  33.66 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000192203  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  35.92 
 
 		 118 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  35.23 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  35.92 
 
 		 118 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  43.48 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  35.92 
 
 		 118 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2315  ribonuclease P  38.78 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  35 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3966  ribonuclease P protein component  37.84 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142048  normal  0.0834112 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03486  ribonuclease P protein component  48.57 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2225  ribonuclease P  38.78 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  34.29 
 
 		 154 aa  50.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  27.64 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6486  ribonuclease P protein  46.88 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00207284  normal  0.0833987 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27050  predicted protein  32.98 
 
 		 164 aa  50.8  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.121605  hitchhiker  0.000860128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1424  ribonuclease P protein component  38.74 
 
 		 122 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  33.96 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  39.73 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5614  ribonuclease P protein component  35.45 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5136  ribonuclease P  35.45 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5745  ribonuclease P  35.45 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936025  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2778  ribonuclease P protein component  45.12 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.07678  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  40.54 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  33.33 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  33.94 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52470  ribonuclease P  33.94 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0001  ribonuclease P  36.7 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2237  ribonuclease P protein component  42.35 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>