197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1969 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 130 aa  254  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  48.74 
 
 		 130 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  44.44 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  48.45 
 
 		 180 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  43.24 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  44.14 
 
 		 116 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  39.66 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3155  ribonuclease P protein component  47.5 
 
 		 87 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0217012  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  44.79 
 
 		 116 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  35.77 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  32.74 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1919  ribonuclease P protein component  54.55 
 
 		 92 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.100919  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  44.79 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  43.75 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  36.04 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  34.23 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  31.53 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  31.53 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  30.28 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  29.2 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  34.62 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  35.14 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  35.14 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  30 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  29.73 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  29.73 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  29.73 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  29.73 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  29.73 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  29.73 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  29.73 
 
 		 115 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  30.63 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  31.07 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  33.03 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  32.26 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  33.9 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  35.48 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  42.35 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  41.44 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  34 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  32.38 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  38.02 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0030  ribonuclease P  37.9 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00687472  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  31.33 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  37.36 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  39.17 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  32.35 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  30.7 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  29.9 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  39.05 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  33.63 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  30.21 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  30.21 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5052  ribonuclease P protein component  32 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107995  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  33.33 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  31.19 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4155  ribonuclease P  36.29 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.58759e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5134  ribonuclease P  37.9 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130238  normal  0.0222111 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03587  ribonuclease P  37.9 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.201936  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4214  ribonuclease P  37.9 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03531  hypothetical protein  37.9 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.118507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3917  ribonuclease P  37.9 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  37.27 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4221  ribonuclease P  37.9 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4071  ribonuclease P  37.9 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00679811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  33.67 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4053  ribonuclease P  37.9 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000316737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4175  ribonuclease P  37.9 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.936833  normal  0.955569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4125  ribonuclease P  37.9 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00333224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4232  ribonuclease P  37.9 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000722418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4068  ribonuclease P  37.9 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000599062  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  26.27 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  30.93 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  28.43 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52470  ribonuclease P  33.6 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  22.81 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  32.54 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  28.44 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2315  ribonuclease P  37.07 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0167  ribonuclease P  32.23 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00183081  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 		 240 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0821  ribonuclease P protein component  32 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  29.77 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0983  ribonuclease P protein component  31 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.162194  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2390  ribonuclease P protein component  30.51 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102633  hitchhiker  0.0000000753131 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  28.57 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  39.44 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2225  ribonuclease P  36.84 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3320  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1040  ribonuclease P protein component  32 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0513155  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4266  ribonuclease P  35.09 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000515429  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  33.71 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  31.62 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4037  ribonuclease P  36.21 
 
 		 119 aa  49.7  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  34.69 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  39.08 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  42.65 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  42.65 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>