101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3116 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  100 
 
 		 147 aa  287  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9055  ribonuclease P protein  58.56 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00175664  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  58.41 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  50.41 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7099  ribonuclease P protein  60 
 
 		 81 aa  87.4  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4512  ribonuclease P protein component  47.83 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  42.52 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  54.65 
 
 		 93 aa  78.6  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  58.46 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  42.24 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  41.94 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3729  ribonuclease P protein component  49.06 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  41.59 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  40.71 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13958  ribonuclease P  39.47 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4699  ribonuclease P protein component  54.74 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  41.13 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  41.13 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  41.13 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  44.14 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  45.13 
 
 		 119 aa  66.6  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  34.62 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6486  ribonuclease P protein  49.3 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00207284  normal  0.0833987 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  38.74 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  31.97 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  41.27 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2557  ribonuclease P protein component  48.05 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000049885  normal  0.280398 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  50 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4592  ribonuclease P protein component  52.07 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000331999  decreased coverage  0.0000978361 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  38.94 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  39.17 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4863  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 132 aa  57  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  38.6 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  30.28 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  29.37 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  29.37 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  29.37 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  29.37 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7340  ribonuclease P protein component  43.31 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  29.37 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  30.28 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  29.82 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  31.5 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39790  ribonuclease P protein component  61.11 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000138929  normal  0.561767 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  36.94 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  38.05 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  30.28 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  34.83 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2160  ribonuclease P protein component  44.09 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  35.19 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  28.44 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4547  ribonuclease P protein component  53.95 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00136145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  28.44 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  34.91 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  44.62 
 
 		 240 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  40.62 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  32.54 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4242  ribonuclease P protein component  38.24 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0023987  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0439  hypothetical protein  31.82 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00442765  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  38.96 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  32.26 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  36.11 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  38.46 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  32.17 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5110  ribonuclease P protein component  52.1 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0820058  unclonable  0.0000000144984 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  39.51 
 
 		 162 aa  45.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  42.67 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  36.75 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  31.58 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  28.07 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  34.43 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  37.36 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  37.36 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  38.82 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0584  hypothetical protein  31.82 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000877288  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  28.97 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  28.97 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  36.36 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4867  hypothetical protein  48.28 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000420631  normal  0.0100767 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  35.9 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  39.44 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  31.86 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  44 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  31.68 
 
 		 227 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  33.06 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  25 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3433  ribonuclease P  32.71 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  41.89 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  38.46 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  26.47 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  41.54 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  41.54 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  36.92 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  32.88 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  31.36 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  29.36 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  30.88 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  42.25 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  32.41 
 
 		 116 aa  40  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  26.85 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>