89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4547 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4547  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 104 aa  194  5.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00136145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7340  ribonuclease P protein component  67.39 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  56.96 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  51.52 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9055  ribonuclease P protein  53.61 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00175664  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  52.33 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  52.13 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  52.13 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  52.13 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7099  ribonuclease P protein  57.33 
 
 		 81 aa  73.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  50.57 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  53.95 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  49.38 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  58.57 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  55 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2557  ribonuclease P protein component  52.7 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000049885  normal  0.280398 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4512  ribonuclease P protein component  52.38 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  42.22 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6486  ribonuclease P protein  49.43 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00207284  normal  0.0833987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  57.32 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4699  ribonuclease P protein component  54.22 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  43.59 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3729  ribonuclease P protein component  57.75 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  43.81 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  31.87 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39790  ribonuclease P protein component  64.18 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000138929  normal  0.561767 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13958  ribonuclease P  38.14 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  42.5 
 
 		 227 aa  51.2  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  39.18 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  31.96 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  30.23 
 
 		 111 aa  50.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4062  ribonuclease P  31.18 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  39.05 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  39.05 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  42.65 
 
 		 240 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  35.42 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  43.48 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  45.45 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2315  ribonuclease P  44.44 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  38.46 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  40.28 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4592  ribonuclease P protein component  65.08 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000331999  decreased coverage  0.0000978361 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  44.58 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  38.64 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2225  ribonuclease P  44.44 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  28.41 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4101  ribonuclease P  30.11 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  29.55 
 
 		 115 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  37.14 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  30.69 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  38.57 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  28.41 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  28.41 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  28.41 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  40.24 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  28.41 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  28.41 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  28.41 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  28.41 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  42.53 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4863  ribonuclease P protein component  43.24 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  38.55 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  28.41 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  38.24 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1539  ribonuclease P protein component  56.06 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000058475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  39.02 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  38.64 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  38.64 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  36.14 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  35.56 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  37.35 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  36.11 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1256  ribonuclease P protein component  37.1 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000286956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  27.27 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1368  ribonuclease P protein component  31.4 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.778952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  45.24 
 
 		 113 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  38.89 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  37.68 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5110  ribonuclease P protein component  66.67 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0820058  unclonable  0.0000000144984 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  52.5 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  32.91 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  34.38 
 
 		 115 aa  40.4  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  37.78 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  30.77 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  23.6 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  23.6 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  36 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03486  ribonuclease P protein component  37.8 
 
 		 109 aa  40  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  38.1 
 
 		 119 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>