66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4512 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4512  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 120 aa  226  7e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  58.04 
 
 		 119 aa  97.1  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7099  ribonuclease P protein  72.46 
 
 		 81 aa  89.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  47.5 
 
 		 127 aa  86.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  47.83 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  47.12 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  44.92 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9055  ribonuclease P protein  49.07 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00175664  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  63.51 
 
 		 93 aa  80.1  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  42.06 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  45.45 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  45.45 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  45.45 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4699  ribonuclease P protein component  50 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39790  ribonuclease P protein component  59.82 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000138929  normal  0.561767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  48.25 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  40.87 
 
 		 136 aa  72  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  49.06 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  51.81 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  41.67 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6486  ribonuclease P protein  50.62 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00207284  normal  0.0833987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13958  ribonuclease P  38.53 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  38.39 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  39.29 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3729  ribonuclease P protein component  47.42 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  33.05 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  44.04 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4863  ribonuclease P protein component  32.03 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2160  ribonuclease P protein component  44.3 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  37.38 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1368  ribonuclease P protein component  29.52 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.778952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2557  ribonuclease P protein component  50.77 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000049885  normal  0.280398 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  26.13 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  28.24 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  25.23 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  25.23 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  34.15 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  25.23 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  25.23 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  25.23 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  25.23 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  25.23 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  39.39 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  35.19 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  25.23 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  23.48 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4592  ribonuclease P protein component  41.8 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000331999  decreased coverage  0.0000978361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7340  ribonuclease P protein component  37.96 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4547  ribonuclease P protein component  52.38 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00136145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5110  ribonuclease P protein component  45 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0820058  unclonable  0.0000000144984 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  22.52 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4242  ribonuclease P protein component  35.66 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0023987  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  34.62 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  31.96 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  36.67 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  36.67 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  35.58 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  35.58 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  26.09 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  29.41 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  30.23 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  36.54 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  28.23 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  35.29 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  29.41 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  36.46 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>