89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5095 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 127 aa  238  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  56.45 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  48.31 
 
 		 118 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  48.31 
 
 		 118 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  48.31 
 
 		 118 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  47.86 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  46.03 
 
 		 125 aa  87  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4512  ribonuclease P protein component  47.5 
 
 		 120 aa  86.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  51.75 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9055  ribonuclease P protein  50 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00175664  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  42.52 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  41.18 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  40.34 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13958  ribonuclease P  37.19 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7099  ribonuclease P protein  56.63 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  44.53 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39790  ribonuclease P protein component  53.97 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000138929  normal  0.561767 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  44.83 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4863  ribonuclease P protein component  39.67 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  41.38 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  61.33 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  38.02 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  48 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  37.27 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3729  ribonuclease P protein component  46.79 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  38.02 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7340  ribonuclease P protein component  42.28 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4699  ribonuclease P protein component  47.06 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  35.4 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  34.86 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2557  ribonuclease P protein component  56.14 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000049885  normal  0.280398 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  34.86 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  37.27 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  26.5 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  32.52 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6486  ribonuclease P protein  45.83 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00207284  normal  0.0833987 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  24.56 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4242  ribonuclease P protein component  35.97 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0023987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  26.13 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2160  ribonuclease P protein component  48.96 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  30.08 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  25.66 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  25.66 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  25.66 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  25.66 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  25.66 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  25.66 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  25.66 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  25.66 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  25.66 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4547  ribonuclease P protein component  58.57 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00136145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  43.4 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  29.79 
 
 		 113 aa  48.1  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  40.57 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  31.86 
 
 		 114 aa  47.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  36.44 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  32.2 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  27.52 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  33.06 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  39.39 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  36.21 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  39.39 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  32.43 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  24.55 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  31.93 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1539  ribonuclease P protein component  42.35 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000058475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  20.87 
 
 		 107 aa  43.5  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  34.86 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4592  ribonuclease P protein component  47.5 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000331999  decreased coverage  0.0000978361 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  26.32 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  26.37 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  26.09 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  38.3 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  32.98 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  37.07 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  29.35 
 
 		 109 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  27.03 
 
 		 111 aa  42  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  32.11 
 
 		 152 aa  41.2  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  28.57 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  31.3 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  31.3 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5110  ribonuclease P protein component  50 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0820058  unclonable  0.0000000144984 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  32.98 
 
 		 180 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1362  ribonuclease P  38.53 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  25.89 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  37.66 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  38.16 
 
 		 137 aa  40.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>