59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13958 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13958  ribonuclease P  100 
 
 
125 aa  246  7e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  51.28 
 
 
119 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  50.91 
 
 
118 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  50.91 
 
 
118 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  50.91 
 
 
118 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  50 
 
 
124 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  37.19 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  40.87 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  39.47 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  44.34 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  34.15 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  42.05 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9055  ribonuclease P protein  39.62 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00175664  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4512  ribonuclease P protein component  38.53 
 
 
120 aa  64.3  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  36.79 
 
 
124 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4863  ribonuclease P protein component  35.94 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  38.46 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  33.66 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7099  ribonuclease P protein  44.12 
 
 
81 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  34.62 
 
 
132 aa  54.7  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3729  ribonuclease P protein component  42.11 
 
 
112 aa  54.3  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  34 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  34 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4242  ribonuclease P protein component  39.71 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0023987  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  38.96 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4699  ribonuclease P protein component  38.46 
 
 
117 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  37.66 
 
 
116 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  37.66 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6486  ribonuclease P protein  41.94 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00207284  normal  0.0833987 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  36.36 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  38.57 
 
 
91 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  25 
 
 
115 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2557  ribonuclease P protein component  41.67 
 
 
91 aa  47  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000049885  normal  0.280398 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  29.27 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  28.41 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  24.11 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  24.11 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  24.11 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  35.71 
 
 
240 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  24.11 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  24.11 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  24.11 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  41.79 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  36.71 
 
 
117 aa  44.7  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  42.62 
 
 
135 aa  43.9  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  24.78 
 
 
115 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  24.44 
 
 
115 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  33.98 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  32.69 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  24.44 
 
 
115 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  27.71 
 
 
115 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  45.9 
 
 
145 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  30.95 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  24.44 
 
 
115 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  27.55 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  29.58 
 
 
154 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2225  ribonuclease P  37.8 
 
 
121 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  31.62 
 
 
132 aa  40  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>