88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3729 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3729  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 112 aa  213  9e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9055  ribonuclease P protein  57.69 
 
 		 109 aa  99.4  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00175664  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  53.98 
 
 		 122 aa  93.6  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  52.53 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  56.19 
 
 		 119 aa  89  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  53.41 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  47.22 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  47.22 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  47.75 
 
 		 125 aa  84.3  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  47.22 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  60.2 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  48.57 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  49.06 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  47.71 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  47.17 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4512  ribonuclease P protein component  47.42 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6486  ribonuclease P protein  54.12 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00207284  normal  0.0833987 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  45.28 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  56 
 
 		 93 aa  72.4  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2557  ribonuclease P protein component  56 
 
 		 91 aa  70.1  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000049885  normal  0.280398 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  46.9 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7099  ribonuclease P protein  55.56 
 
 		 81 aa  67.4  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  38.89 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13958  ribonuclease P  42.11 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4863  ribonuclease P protein component  38.6 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  43.14 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4699  ribonuclease P protein component  51.43 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7340  ribonuclease P protein component  55.56 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39790  ribonuclease P protein component  54.9 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000138929  normal  0.561767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  39.6 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  28.16 
 
 		 115 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  28.16 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  28.97 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  28.16 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  28.16 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  28.16 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  28.16 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  28.16 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4547  ribonuclease P protein component  56.63 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00136145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  28.16 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  47.19 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  27.18 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  27.18 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  28.43 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  46.03 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  46.05 
 
 		 240 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  24.51 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  24.51 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2160  ribonuclease P protein component  53.75 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  29.17 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  36.56 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  28.57 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1539  ribonuclease P protein component  49.38 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000058475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1368  ribonuclease P protein component  31.73 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.778952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  27.27 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  37 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  37 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4592  ribonuclease P protein component  60.32 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000331999  decreased coverage  0.0000978361 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4101  ribonuclease P  28.04 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  38.89 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  33.68 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4062  ribonuclease P  28.43 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0857  ribonuclease P protein component  29.81 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4242  ribonuclease P protein component  36.8 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0023987  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  35.71 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  24.77 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  25.69 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5110  ribonuclease P protein component  66.1 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0820058  unclonable  0.0000000144984 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  36.67 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  33 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  30.97 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  32.35 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  26.23 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  30.97 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  24.56 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  38.27 
 
 		 126 aa  42  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  26.21 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  22.08 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  36.59 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  41.67 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  36.84 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  36.36 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  40.48 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  27.18 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  25 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  43.86 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>