68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2557 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2557  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 91 aa  181  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000049885  normal  0.280398 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  51.69 
 
 		 91 aa  80.1  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  53.09 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6486  ribonuclease P protein  56 
 
 		 89 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00207284  normal  0.0833987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4699  ribonuclease P protein component  57.69 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9055  ribonuclease P protein  52.56 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00175664  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  54.67 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  58.33 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  54.65 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  45.35 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7099  ribonuclease P protein  57.14 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  51.61 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  48 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  48 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  48 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  52 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  48.05 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  46.15 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  50 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3729  ribonuclease P protein component  58.06 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  44.93 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  57.81 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  50 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  56.14 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4512  ribonuclease P protein component  50.77 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  39.33 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  46.58 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  46.48 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4592  ribonuclease P protein component  63.93 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000331999  decreased coverage  0.0000978361 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  37.5 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  36.67 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7340  ribonuclease P protein component  45.74 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  51.79 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  44.87 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13958  ribonuclease P  41.67 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  46.77 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39790  ribonuclease P protein component  50.63 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000138929  normal  0.561767 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0584  hypothetical protein  57.5 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000877288  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1256  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000286956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  39.71 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  34.92 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  40 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  43.59 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  43.94 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  51.22 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  36.84 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4547  ribonuclease P protein component  52.7 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00136145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  51.22 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  41.94 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  61.54 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  41.94 
 
 		 115 aa  44.3  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0439  hypothetical protein  56.76 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00442765  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  33.33 
 
 		 119 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  33.33 
 
 		 119 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  33.33 
 
 		 115 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  33.33 
 
 		 119 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  33.33 
 
 		 115 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  33.33 
 
 		 119 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 		 114 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  33.33 
 
 		 119 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  43.75 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2523  ribonuclease P protein component  49.18 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0265349  hitchhiker  0.0000065266 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  45.31 
 
 		 132 aa  41.2  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  62.96 
 
 		 240 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  39.06 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  35.94 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3433  ribonuclease P  40.98 
 
 		 140 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  35 
 
 		 115 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>