129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1539 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1539  ribonuclease P protein component  100 
 
 
98 aa  190  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000058475  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0133  ribonuclease P protein component  67.86 
 
 
110 aa  85.9  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  47.3 
 
 
120 aa  60.5  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  44.94 
 
 
93 aa  60.5  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  53.52 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7099  ribonuclease P protein  52.05 
 
 
81 aa  57.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  42.03 
 
 
145 aa  56.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  46.38 
 
 
114 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  44.44 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  37.66 
 
 
116 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1256  ribonuclease P protein component  47.83 
 
 
115 aa  56.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000286956  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  55.36 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  42.03 
 
 
145 aa  54.7  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  42.03 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  44.19 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  49.23 
 
 
119 aa  54.7  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  41.79 
 
 
240 aa  53.9  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9055  ribonuclease P protein  48.68 
 
 
109 aa  53.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00175664  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  40.28 
 
 
132 aa  53.5  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  45.57 
 
 
147 aa  52.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  39.08 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3729  ribonuclease P protein component  52.56 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  52.24 
 
 
122 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  52.24 
 
 
122 aa  53.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  51.52 
 
 
91 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  39.44 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  38.96 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  41.18 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  48.61 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  41.67 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  38.89 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  34.72 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  47.69 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  45.45 
 
 
118 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  45.45 
 
 
118 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  45.45 
 
 
118 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  40.26 
 
 
117 aa  50.4  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  44.78 
 
 
150 aa  50.4  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  38.03 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  35.71 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  42.11 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4512  ribonuclease P protein component  47.22 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  42.19 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  39.19 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  43.04 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000601305  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0983  ribonuclease P protein component  38.81 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.162194  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  42.68 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0821  ribonuclease P protein component  40.3 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6486  ribonuclease P protein  50 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00207284  normal  0.0833987 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  40.3 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1040  ribonuclease P protein component  40.3 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0513155  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  42.86 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  34.33 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  44.62 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  31.65 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  37.88 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  38.46 
 
 
227 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  43.04 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  37.68 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2557  ribonuclease P protein component  54.84 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000049885  normal  0.280398 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  44.62 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  31.65 
 
 
115 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  31.65 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  31.65 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  31.65 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  40 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  31.65 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  35.53 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  47.69 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  41.67 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  36.76 
 
 
106 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  40.62 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  40.91 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  31.65 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  40.91 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  31.65 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  32.91 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  55.32 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  40.28 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  40.28 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  30.38 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  36.36 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  29.11 
 
 
115 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5376  ribonuclease P protein  32.56 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827192  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  48.44 
 
 
124 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  42.86 
 
 
116 aa  44.3  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5080  ribonuclease P protein component  39.39 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.479331 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  35.21 
 
 
115 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  44.44 
 
 
129 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  53.19 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  50 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  51.06 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0439  hypothetical protein  41.38 
 
 
119 aa  43.9  0.0007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00442765  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  35.29 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  35.29 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  49.21 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0584  hypothetical protein  64.52 
 
 
119 aa  43.5  0.0009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000877288  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  41.54 
 
 
132 aa  43.5  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>