56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1040 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1040  ribonuclease P protein component  100 
 
 
108 aa  213  5e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0513155  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0821  ribonuclease P protein component  98.15 
 
 
108 aa  212  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0983  ribonuclease P protein component  97.22 
 
 
108 aa  211  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.162194  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0552  ribonuclease P protein component  50 
 
 
110 aa  106  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0552  ribonuclease P protein component  64.2 
 
 
81 aa  99.4  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1829  ribonuclease P protein component  60 
 
 
80 aa  92.8  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1621  hypothetical protein  59.02 
 
 
61 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0650  ribonuclease P protein component (RNaseP protein) (RNaseP protein) (protein C5)  43.48 
 
 
69 aa  69.3  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.963199  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  46.38 
 
 
79 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  33.64 
 
 
121 aa  59.3  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  31.58 
 
 
117 aa  59.3  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  37.76 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  29.2 
 
 
115 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  29.2 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  28.7 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  28.7 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  28.7 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  28.7 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  28.7 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  34 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  28.32 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  30.91 
 
 
126 aa  55.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  28.32 
 
 
115 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  31.73 
 
 
109 aa  54.3  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  32.73 
 
 
121 aa  52.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  28.04 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  27.43 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  31.68 
 
 
116 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  30.28 
 
 
120 aa  51.2  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  32 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  32.32 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  29.52 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  29.52 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  30.33 
 
 
131 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  31.96 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  33.67 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  34.52 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1265  ribonuclease P protein component  33.82 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000149389  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  30.91 
 
 
120 aa  42.7  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  28.43 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  25.96 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  30.69 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3123  ribonuclease P protein component  28.57 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000870513  hitchhiker  0.0000000610775 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  26.53 
 
 
119 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  27.91 
 
 
130 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  30.77 
 
 
125 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  30.77 
 
 
125 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  30.91 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  29.17 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  29.49 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  25 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  30 
 
 
189 aa  40.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  25.93 
 
 
109 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  24.75 
 
 
117 aa  40  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  24.75 
 
 
117 aa  40  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  38.33 
 
 
135 aa  40  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>